Der Hauptunterschied zwischen QTL und GWAS hängt von der Art der Sequenzen ab, die in der Analyse verwendet werden. QTL verwendet Kopplungsgenorte, um phänotypische Merkmale zu analysieren, die mit polygener Vererbung assoziiert sind, während GWAS ganze Genomsequenzen verwendet, um einzelne Nukleotidpolymorphismen einer bestimmten Erkrankung zu analysieren.
QTL-Karten und GWAS spielen eine wichtige Rolle bei der genetischen Analyse verschiedener Merkmale. Darüber hinaus sind sie bei der Analyse verschiedener Krankheitszustände mit unbekannter Ätiologie wichtig. Darüber hinaus spielt die Sequenzierung bei beiden Techniken eine Schlüsselrolle. Diese Techniken können ferner mit anderen Hochdurchsatztechniken für erhöhte Genauigkeit und Präzision gekoppelt werden.
Was ist QTL?
QTL steht für Quantitative Trait Locus. Es ist eine Region der DNA, die mit einem phänotypischen Merkmal assoziiert ist. Im Allgemeinen führt ein QTL zu polygenen Effekten. Die Verteilung der QTLs variiert, und die Anzahl der QTLs deutet auf den Variationsgrad eines bestimmten phänotypischen Merkmals hin. Darüber hinaus kodieren sie typischerweise für zugrunde liegende kontinuierliche Merkmale und nicht für diskrete Merkmale.
Nach der Identifizierung der QTL-Regionen ist es wichtig, einen bestimmten QTL-Bereich zu sequenzieren. Um Untersuchungen und Forschungen zu erleichtern, erfolgt außerdem die Sequenzierung und Speicherung der Sequenzdaten der gemeinsamen QTL-Regionen unter Einbeziehung der Bioinformatik. Wir nennen diese Technik QTL-Mapping. Anschließend wird eine Datenbank mit den Sequenzen der QTL-Region aufgebaut.
Abbildung 01: QTL-Scan
Darüber hinaus verlassen sich die Anwendungen von QTL-Sequenzen hauptsächlich auf das BLAST-Tool, mit dem die Sequenzähnlichkeit bestimmt werden kann. Es ist wichtig, um Beziehungen zwischen Organismen abzuleiten. Darüber hinaus ist es wichtig, die Komplexität eines bestimmten polygenen Phänotyps zu bestimmen. Es bestimmt auch die Entwicklung eines bestimmten Merkmals.
Derzeit wird die QTL-Analyse mit anderen Hochdurchsatztechniken wie DNA-Microarrays kombiniert. Dies ist bei der Expressionsanalyse des Phänotyps wichtig. Derzeit sind Wissenschaftler sehr an der Entwicklung der QTL-Datenbank interessiert, da QTL-Regionen für viele wichtige Merkmale verschiedener Arten verantwortlich sind.
Was ist GWAS?
GWAS steht für Genome Wide Association Study. Es bezieht sich auch auf Assoziationsstudien des gesamten Genoms. Diese Studien konzentrieren sich hauptsächlich auf Beobachtungsstudien. Es analysiert die genetischen Varianten verschiedener Individuen, die normalerweise mit einem bestimmten Merkmal in Verbindung gebracht werden. Darüber hinaus ist das gesamte Genom für die GWAS-Analyse wichtig.
Abbildung 02: GWAS
GWAS ist ein wichtiges Werkzeug bei der Analyse von Einzelnukleotid-Polymorphismen, die mit verschiedenen Krankheitszuständen assoziiert sind. Dies ist auch eine vergleichende Studie der verschiedenen Einzelnukleotid-Polymorphismen über eine breite Population hinweg. Zudem ist die Studienstichprobe der GWAS sehr hoch; daher hat sie auch das Format einer Querschnitts-Kohortenstudie.
Darüber hinaus fand die erste GWAS-Studie zum Thema Myokardinfarkt und der Analyse der mit Myokardinfarkt assoziierten Gene statt. Gegenwärtig spielt GWAS eine wichtige Rolle bei der Bestimmung des genetischen Hintergrunds komplexer Krankheiten mit unbekannter Ätiologie.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen QTL und GWAS?
- Sie verlassen sich für die Analyse auf DNA-Sequenzdaten.
- Beide sind mit den genetischen Hintergründen verschiedener Charaktere verbunden.
- Außerdem benötigen sie bioinformatische Werkzeuge, um die Ergebnisse abzuleiten und zu interpretieren.
- Sie werden an großen Populationen durchgeführt.
Was ist der Unterschied zwischen QTL und GWAS?
QTL analysiert die phänotypischen Merkmale, die mit der polygenen Vererbung verbunden sind, unter Verwendung verknüpfter Genloci, während GWAS einzelne Nukleotidpolymorphismen eines bestimmten Zustands unter Verwendung ganzer Genomsequenzen analysiert. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen QTL und GWAS. QTL-Mapping ist vergleichsweise eine weniger komplexe Technik als GWAS, da es eine Sequenzierung des gesamten Genoms erfordert.
Die folgende Infografik fasst den Unterschied zwischen QTL und GWAS in tabellarischer Form zusammen.
Zusammenfassung – QTL vs. GWAS
QTL-Mapping und GWAS spielen eine wichtige Rolle bei der Bestimmung des genetischen Hintergrunds verschiedener phänotypischer Merkmale. Sie helfen auch bei der Analyse des genetischen Hintergrunds verschiedener Krankheiten. Die QTL-Kartierung kartiert die Kopplungsgene, die für kontinuierliche Merkmale verantwortlich sind, und beinh altet auch die Kartierung der polygenen Vererbungsgene. GWAS hingegen erfolgt mit einer Analyse des gesamten Genoms auf Einzelnukleotid-Polymorphismen. Darüber hinaus findet dies über eine größere Population statt. Dies ist also die Zusammenfassung des Unterschieds zwischen QTL und GWAS.
