Der Hauptunterschied zwischen Kandidatengen und GWAS besteht darin, dass der Kandidatengen-Ansatz die genetische Variation innerhalb einer kleinen Anzahl von vordefinierten Genen von Interesse untersucht, während GWAS das gesamte Genom auf eine gemeinsame genetische Variation hinter einem bestimmten Krankheitszustand untersucht.
Kandidatengenansatz und genomweite Assoziationsstudien (GWAS) sind zwei Methoden, die wichtig sind, um die genetische Anfälligkeit für Krankheiten zu erkennen. Der Kandidatengenansatz basiert auf einer vorab festgelegten kleinen Anzahl von Genen, während GWAS auf dem Testen des gesamten Genoms basiert. Daher erfordert der Kandidatengenansatz im Gegensatz zu GWAS Vorkenntnisse über krankheitsrelevante Gene.
Was ist ein Kandidatengen?
Kandidatengen-Ansatz ist eine der Techniken, die den Zusammenhang zwischen genetischer Variation innerhalb vordefinierter interessierender Gene und Phänotypen oder Krankheitszuständen untersucht. Bei diesem Ansatz ist es notwendig, Vorkenntnisse über die biologischen funktionellen Auswirkungen des Gens auf das betreffende Merkmal oder die betreffende Krankheit zu haben. Basierend auf diesem Wissen wird eine kleine Anzahl von Genen ausgewählt und auf genetische Variation analysiert.
Abbildung 01: Kandidatengen-Ansatz
Die Auswahl der Gene erfolgt bei diesem Ansatz anhand der biologischen, physiologischen und funktionellen Relevanz für die jeweilige Erkrankung. Dieser Ansatz ist oft als Fall-Kontroll-Studie angelegt.
Was ist GWAS?
GWAS steht für Genome-Wide Association Study. Es bezieht sich auch auf Gesamtgenom-Assoziationsstudien. Diese Studien konzentrieren sich hauptsächlich auf Beobachtungsstudien. Sie analysieren die genetischen Varianten verschiedener Individuen, die normalerweise mit einem bestimmten Merkmal in Verbindung gebracht werden. Das gesamte Genom ist wichtig für die GWAS-Analyse.
GWAS ist ein wichtiges Werkzeug bei der Analyse von Einzelnukleotid-Polymorphismen, die mit verschiedenen Krankheitszuständen assoziiert sind. Es ist eine vergleichende Studie der verschiedenen Einzelnukleotid-Polymorphismen über eine breite Population hinweg. Die Studienstichprobe der GWAS ist sehr hoch; daher hat sie auch das Format einer Querschnitts-Kohortenstudie.
Abbildung 02: GWAS
Die erste GWAS-Studie fand zum Thema Myokardinfarkt und der Analyse der mit Myokardinfarkt assoziierten Gene statt. Gegenwärtig spielt GWAS eine wichtige Rolle bei der Bestimmung des genetischen Hintergrunds komplexer Krankheiten mit unbekannter Ätiologie.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Kandidatengen und GWAS?
- Sowohl der Kandidatengenansatz als auch GWAS sind Techniken, die die genetische Assoziation zwischen Genotyp und Phänotyp der Krankheit analysieren.
- Beide Ansätze helfen, die genetischen Grundlagen der Krankheitsanfälligkeit zu verstehen.
Was ist der Unterschied zwischen Kandidatengen und GWAS?
Kandidatengen-Ansatz basiert auf den Kandidatengenen oder vorab spezifizierten Genen, während GWAS auf dem gesamten Genom basiert. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Kandidatengen und GWAS. Auch beim Kandidatengen-Ansatz ist die Selektion von Genen notwendig, während sie bei GWAS nicht benötigt wird.
Darüber hinaus erfordert der Kandidatengen-Ansatz Vorkenntnisse über die für die Krankheit relevanten Gene, während dies für GWAS nicht erforderlich ist.
Die folgende Infografik bietet einen detaillierteren Vergleich in Bezug auf den Unterschied zwischen Kandidatengen und GWAS.
Zusammenfassung – Kandidatengen vs. GWAS
Kandidatengen und GWAS sind zwei Genassoziationsstudien. Der Kandidatengen-Ansatz konzentriert sich auf die genetische Variation, die mit der Krankheit innerhalb einer kleinen Anzahl von vordefinierten Genen verbunden ist. GWAS hingegen untersucht die mit der Krankheit assoziierte genetische Variation innerhalb des gesamten Genoms. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Kandidatengen und GWAS. Beide Methoden sind wichtig, um die genetischen Grundlagen der Krankheitsanfälligkeit zu verstehen.
