Der Hauptunterschied zwischen Rho-abhängiger und Rho-unabhängiger Termination besteht darin, dass bei Rho-abhängiger Termination der Rho-Faktor an das Transkript bindet und die Transkription durch Aufbrechen von Wasserstoffbrückenbindungen zwischen der Vorlage und dem Transkript beendet, während die Rho-unabhängige Termination die Transkription beendet durch Erzeugen einer Haarnadelschleifenstruktur und dann einer U-reichen Region im Transkript.
Die Transkription ist eine der beiden Phasen der Genexpression. Es ist der Prozess, der eine mRNA-Sequenz aus der genetischen Information erzeugt, die in der DNA-Sequenz des Gens verborgen ist. Die Transkription erfolgt in drei Schritten: Initiation, Elongation und Termination. Das Enzym RNA-Polymerase bindet an die Promotorsequenz des Gens und beginnt mit der Katalyse der Synthese des RNA-Strangs. Bis die Terminatorsequenz gefunden ist, fügt die RNA-Polymerase Nukleotide hinzu und baut den RNA-Strang auf. In Prokaryoten erfolgt die Terminierung durch zwei Hauptterminierungsstrategien: Rho-abhängige Terminierung und Rho-unabhängige Terminierung. Der Rho-Faktor ist ein Protein mit Helikase-Aktivität.
Was ist Rho-abhängige Beendigung?
Rho-abhängige Termination ist eine der beiden Arten der Transkriptionsterminationsstrategie, die in Prokaryoten auftritt. Der Rho-Faktor ist ein Protein mit Helikase-Aktivität.
Abbildung 01: Rho-abhängige Terminierung
Rho-Protein bindet an das RNA-Transkript und bewegt sich entlang der RNA-Polymerase in 5'-3'-Richtung, wodurch die Dissoziation von Wasserstoffbrückenbindungen zwischen der DNA-Matrize und dem RNA-Transkript gefördert wird. Wenn der Rho-Faktor die Transkriptionsblase erreicht, zieht er das DNA/RNA-Hybrid auseinander und setzt das Transkript aus der Transkriptionsblase frei. In diesem Fall wird die Transkription beendet.
Was ist eine Rho-unabhängige Terminierung?
Rho-unabhängige Termination ist die zweite Strategie, die die prokaryotische Transkription beendet. Üblicherweise hat eine Terminatorregion eine invertierte Wiederholungssequenz. Unmittelbar nach der invertierten Wiederholungssequenz gibt es eine Adenin-reiche Region (AAAA). Wenn sich die RNA-Polymerase fortbewegt, produziert sie eine mRNA-Sequenz. Da die beiden Regionen in der invertierten Wiederholungssequenzregion komplementär sind, bildet sie aufgrund von Wasserstoffbindungen eine Haarnadelschleifenstruktur. Die nächste Region wird die U-reiche Region sein. Die Haarnadelstruktur beendet die Aktivität der RNA-Polymerase.
Abbildung 02: Rho Unabhängige Terminierung
Darüber hinaus gibt es in den U-reichen Regionen schwache Wechselwirkungen zwischen den U-Basen des Transkripts und den A-Basen der Matrize. Diese schwachen Adenin-Uracil-Bindungen destabilisieren das DNA-Template und das RNA-Transkript und trennen sich voneinander. Am Ende wird das Transkript von der Transkriptionsstelle freigesetzt.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Rho-abhängiger und Rho-unabhängiger Kündigung?
- Rho-abhängige und Rho-unabhängige Termination sind zwei wichtige Terminierungsstrategien, die bei Prokaryoten zu finden sind.
- Beide Formen setzen ein Transkript aus der DNA-Matrize frei, um die Transkription zu beenden.
Was ist der Unterschied zwischen Rho-abhängiger und Rho-unabhängiger Kündigung?
Rho-abhängige Termination wird durch ein Rho-Protein vermittelt, während Rho-unabhängige Termination über die Bildung einer Haarnadelschleifenstruktur erfolgt. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Rho-abhängiger und Rho-unabhängiger Terminierung. Darüber hinaus verwendet das Rho-Protein ATP-Energie, während die Rho-unabhängige Terminierung kein Rho-Protein beinh altet und keine ATP-Energie verwendet. Daher ist dies auch ein signifikanter Unterschied zwischen Rho-abhängiger und Rho-unabhängiger Terminierung.
Die folgende Infografik zeigt weitere Vergleiche in Bezug auf den Unterschied zwischen Rho-abhängiger und Rho-unabhängiger Terminierung.
Zusammenfassung – Rho-abhängige vs. Rho-unabhängige Kündigung
Rho-abhängige und Rho-unabhängige Termination sind die beiden Hauptterminationsmechanismen der Transkription, die in Prokaryoten auftreten. Ein Rho-Protein ist für die Termination der Transkription bei der Rho-abhängigen Termination verantwortlich. Im Gegensatz dazu erfolgt die Rho-unabhängige Terminierung über eine Bildung der Haarnadelschleifenstruktur. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Rho-abhängiger und Rho-unabhängiger Terminierung.
