Hauptunterschied – Stapelgel vs. Trenngel
Die Begriffe Sammelgel und Trenngel werden zur Erläuterung der SDS-PAGE-Technik verwendet. SDS-PAGE oder Natriumdodecylsulfat-Polyacrylamid-Gelelektrophorese ist eine Labortechnik, die verwendet wird, um Proteinmoleküle basierend auf ihrem Molekulargewicht zu trennen. Die Theorie hinter der Technik ist, dass Proteine mit unterschiedlichen Molekulargewichten unterschiedliche Migrationsraten zeigen; Moleküle mit niedrigem Molekulargewicht wandern schneller, während Moleküle mit hohem Molekulargewicht langsam wandern. Das Migrationsmedium ist ein Gel. Es gibt zwei Arten von Gelen, die als Stapelgel und Trenngel bezeichnet werden. Der Hauptunterschied zwischen Sammelgel und Trenngel besteht darin, dass der pH-Wert des Sammelgels 6,8 beträgt, während der pH-Wert des Trenngels 8,8 beträgt.
Was ist Stapelgel?
Stapelgel ist ein niedrig konzentriertes Polyacrylamidgel, das in der SDS-PAGE-Technik auf ein stärker konzentriertes Trenngel (Trenngel) aufgebracht wird. Das Sammelgel wird verwendet, um die Auflösung der Elektrophorese zu verbessern. Die Auflösung erhöht sich aufgrund des Unterschieds zwischen den Konzentrationen des Sammelgels und des Auflösungsgels, die sich auf die Proteine in der Probe auswirken. Da die Konzentration von Polyacrylamid im Sammelgel gering ist, ist die Porengröße höher. Dies hilft auch bei der Erhöhung der Trennung.
Das Stapelgel ist ein loses Polyacrylamidgel mit großen Poren aus ca. 7% Polyacrylamid. Diese Poren wirken nicht als erhebliche Barriere für große Proteinmoleküle. Daher wirkt sich dieses Gel geringfügig auf die Mobilität dieser Proteine aus. Dies macht eine Trennung gemäß der Mobilität und Größe von Proteinen, indem sie zwischen zwei Gelen konzentriert werden.
Abbildung 01: SDS-PAGE Acrylamidgel
Der pH-Wert des Sammelgels beträgt 6,8. Sein pH-Wert ist um 2 pH-Einheiten sauer als der des Auflösungsgels. Dieser pH impliziert eine niedrigere Ionenstärke und somit einen höheren elektrischen Widerstand. Dies provoziert die Mobilität von Proteinen als andere im Gel vorhandene geladene Partikel.
Was ist Trenngel?
Trenngel oder Trenngel einer SDS-PAGE-Technik ist ein hochkonzentriertes Polyacrylamidgel, das auf ein niedrigkonzentriertes Sammelgel aufgebracht wird. Das Trenngel enthält einen hohen Anteil an Polyacrylamid (10 %). Der pH-Wert dieses Gels wird bei pH=8,8 geh alten, was ein höherer pH-Wert ist als der des Sammelgels.
Abbildung 02: Ein Gelelektrophorese-Apparat
Wenn die Proteinmoleküle das Trenngel erreichen, wird die Wanderung dieser Moleküle verlangsamt, weil das Trenngel ein hochkonzentriertes Gel mit einer kleinen Porengröße ist, die als beträchtliche Barriere für die Bewegung der Proteinmoleküle wirken kann. Diese Verlangsamung ermöglicht es den anderen Proteinen, langsam zu wandern, um aufzuholen, was zu einer schmalen, konzentrierten Bande zwischen den beiden Gelen führt.
Was ist die Beziehung zwischen Stapelgel und Trenngel?
Beide Arten von Sammelgelen und Trenngelen werden in derselben Apparatur verwendet
Was ist der Unterschied zwischen Sammelgel und Trenngel?
Stapelgel vs. Trenngel |
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| Stapelgel ist ein niedrig konzentriertes Polyacrylamidgel, das in der SDS-PAGE-Technik auf ein stärker konzentriertes Trenngel (Trenngel) aufgebracht wird. | Trenngel oder Trenngel einer SDS-PAGE-Technik ist ein hochkonzentriertes Polyacrylamidgel, das auf ein niedrigkonzentriertes Sammelgel aufgebracht wird. |
| Platzierung | |
| Stapelgel wird auf das Trenngel (Trenngel) gegeben. | Trenngel wird auf den Boden des Behälters für die Gelelektrophorese gegeben. |
| Konzentration | |
| Die Konzentration des Sammelgels ist hoch. | Die Konzentration des Trenngels ist gering. |
| Polyacrylamidgeh alt | |
| Stapelgel enthält ca. 7 % Polyacrylamid. | Trenngel enthält ca. 10 % Polyacrylamid. |
| pH | |
| Der pH-Wert des Sammelgels beträgt 6,8. | Der pH-Wert des Trenngels beträgt 8,8. |
| Porengröße | |
| Stapelgel weist große Poren auf. | Im Trenngel sind kleine Porengrößen vorhanden. |
| Auflösung | |
| Stapelgel ergibt eine bessere Auflösung. | Trenngel ergibt eine schlechte Auflösung. |
Zusammenfassung – Stapelgel vs. Trenngel
Stapelgel und Trenngel sind zwei Arten von Polyacrylamidgelen, die zur besseren Trennung von Proteinmolekülen in einer bestimmten Probe verwendet werden. Der Unterschied zwischen Sammelgel und Trenngel besteht darin, dass der pH-Wert des Sammelgels 6,8 beträgt, während der pH-Wert des Trenngels 8,8 beträgt.
