Der Hauptunterschied zwischen Cosmid und Phagemid liegt in der Art der enth altenen Sequenzen. Ein Cosmid enthält eine cos-Stelle und ein Plasmid. Daher ist es ein Hybridvektor, während ein Phagemid ein Plasmid ist, das einen F1-Replikationsursprung des F1-Phagen enthält.
Cosmide und Phagemide werden zum Klonen verwendet, insbesondere zum Klonen größerer DNA-Fragmente. Diese finden insbesondere beim Klonen von Genen, die für die Produktion verschiedener Proteine verantwortlich sind, breite Anwendung. Cosmide und Phagemide werden entweder alleine als Plasmide repliziert oder in virale Partikel verpackt und dann repliziert.
Was ist ein Cosmid?
Ein Cosmid, das als Hybridplasmid bezeichnet wird, umfasst cos-Stellen, die aus Lambda-Phagenpartikeln extrahiert wurden, und ein Plasmid. Diese cos-Stellen sind lange DNA-Fragmente mit 200 Basenpaaren. Daher haben sie kohäsive oder klebrige Enden, die es dem Plasmid ermöglichen, in die virale DNA zu passen. Daher sind die cos-Stellen entscheidend für die Verpackung der DNA.
Es gibt drei cosites;
- cosN-Stelle – beteiligt am Nicken des DNA-Strangs durch Terminase-Aktivität
- cosB-Site – beteiligt an der Aufbewahrung der Terminase.
- cosQ-Stelle – daran beteiligt, den Abbau der DNA durch DNasen zu verhindern.
Abbildung 01: Cosmid
Außerdem können Cosmide entweder einzelsträngige DNA oder doppelsträngige DNA unter Verwendung eines geeigneten Replikationsursprungs replizieren. Cosmide enth alten üblicherweise Antibiotikaresistenzgene als Marker für die Selektion von Transformanten. Somit kann die Verwendung eines Cosmids als Vektor das Klonen erleichtern, und der Restriktionsenzymverdau des Vektors kann dann diese Fragmente extrahieren.
Was ist ein Phagemid (Phasmid)?
Phagemid, auch als Phasmid bezeichnet, ist ebenfalls eine Art Hybridvektor. Phagemid enthält einen speziellen Replikationsursprung, der als f1-Replikationsursprung bezeichnet wird. Der f1-Replikationsursprung wird aus einem f1-Phagen extrahiert.
Phagemid kann sowohl einzelsträngige als auch doppelsträngige DNA replizieren. Die Replikation kann entweder als Plasmid erfolgen, während sie einer unabhängigen Replikation unterzogen wird, oder sie kann in Phagenpartikel verpackt werden und schließlich den bakteriellen Wirt E. coli infizieren. Bei der Infektion der E. coli-Zellen benötigt der f1-Phage die Anwesenheit eines Pilus. Daher sind die Geschlechts-Pili während der In-vitro-Verpackung von Phagemiden wichtig.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Cosmid und Phagemid?
- Sowohl Cosmid als auch Phagemid sind Klonierungsvektoren, die in der rekombinanten DNA-Technologie verwendet werden.
- Cosmid und Phagemid können einzelsträngige und doppelsträngige DNA replizieren.
- Beide können sich ähnlich wie Plasmide unabhängig replizieren.
- Cosmid und Phagemid können in vitro verpackt werden und Bakterienzellen infizieren.
- Sowohl Cosmid als auch Phagemid benötigen einen geeigneten Replikationsursprung zum Klonen.
Was ist der Unterschied zwischen Cosmid und Phagemid?
Cosmid gegen Phagemid |
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| Cosmid ist ein Hybridvektor, der eine cos-Stelle und ein Plasmid enthält. | Phagemid ist ein Plasmid, das einen F1-Replikationsursprung des F1-Phagen enthält. |
| Vorhandensein von Cos-Standorten | |
| Cosmid-Stellen sind vorhanden und für die In-vitro-Verpackung notwendig. | Weil Stellen im Phagemid fehlen. |
| Vorhandensein des F1-Replikationsursprungs | |
| Im Cosmid kann fi der Replikationsursprung vorhanden sein oder nicht. | F1-Replikationsursprung ist im Phagemid vorhanden. |
| Vorhandensein antibiotikaresistenter Gene | |
| Antibiotika-resistente Gene sind in Cosmiden vorhanden, um die Transformanten von Nicht-Transformanten zu unterscheiden. | Antibiotika-resistente Gene fehlen in Phagemiden. |
| Anforderung der In-vitro-Verpackung | |
| Cos-Site erforderlich. | Erfordert einen Sex-Pilus. |
Zusammenfassung – Cosmid vs. Phagemid
Cosmid und Phagemid sind Klonierungsvektoren, die in der rekombinanten DNA-Technologie verwendet werden. Cosmide sind hybride Vektoren, die spezielle klebrige Enden enth alten, die als cos-Stellen bekannt sind. In-vitro-Verpackungen erfordern diese cos-Sites. Während Phagemide Plasmide sind, die einen aus f1-Phagen extrahierten f1-Replikationsursprung enth alten. Sowohl Cosmid als auch Phagemid können unabhängig repliziert oder in vitro in Bakterienzellen verpackt werden. Dies sind die wichtigen Unterschiede zwischen Cosmid und Phagemid.
