Der Hauptunterschied zwischen CDS und ORF besteht darin, dass CDS die tatsächliche Nukleotidsequenz eines Gens ist, die in ein Protein übersetzt wird, während ORF ein Abschnitt einer DNA-Sequenz ist, der mit der Translationsinitiationsstelle (Startcodon) beginnt und mit a endet Übersetzungsterminationsstelle (Stoppcodon).
Ein Gen hat eine kodierende Sequenz (CDS). Es besteht aus allen Exons des Gens und einem Startcodon und einem Stopcodon. Es ist der eigentliche Teil des Gens, der das Protein übersetzt und produziert. Offener Leserahmen oder ORF ist eine Nukleotidsequenz, die sich zwischen einem Startcodon und einem Stopcodon befindet. Es gibt kein Stoppcodon innerhalb eines ORF, das den genetischen Code unterbricht, der in ein Protein übersetzt wird. Bei Prokaryoten sind CDS und ORF eines Gens gleich.
Was ist CDS?
CDS oder kodierende Sequenz ist der Teil des Gens, der tatsächlich in ein Protein übersetzt wird. Es besteht aus Exons und zwei Codons, die als AUG-Codon und Stoppcodon bekannt sind. CDS enthält keine zwei nicht übersetzten Regionen: 5' UTR und 3 UTR. Darüber hinaus sind Introns nicht in CDS enth alten.
Abbildung 01: Codierungssequenz
Im Vergleich zum gesamten Genom eines Individuums sind kodierende Sequenzen nur ein kleiner Bruchteil. Die kodierende Sequenz besteht aus der notwendigen Nukleotidsequenz, um die Aminosäuresequenz des Proteins zu erstellen. Daher sind CDS konzentrierte Exons, die in Nukleotidtripletts oder Codons unterteilt werden können. Aus Codons entstehen Aminosäuren.
Was ist ein ORF?
Offener Leserahmen oder ORF ist die kontinuierliche Strecke einer Nukleotidsequenz, die mit einem Startcodon beginnt und mit einem Stoppcodon endet. In einfachen Worten bezieht sich ORF auf die Region der Nukleotidsequenz, die sich zwischen Start- und Stoppcodons befindet. Dazwischen gibt es kein Stoppcodon, das den ORF unterbricht. Die Nukleotidsequenz zwischen Start- und Stoppcodon kodiert für Aminosäuren. Im Allgemeinen ist das Startcodon ATG, während die Stoppcodons TAG, TAA und TGA sind. ORF ergibt ein funktionelles Protein, wenn es transkribiert und translatiert wird. Daher enthält ORF ein Startcodon, mehrere Codons in der mittleren Region und ein Stopcodon. Interessanterweise hat ORF eine Länge, die durch drei teilbar ist.
Abbildung 02: Offener Leserahmen
In Prokaryoten ist ORF die kodierende Sequenz eines Gens, das direkt in mRNA transkribiert wird, da es keine Introns gibt. Daher sind CDS und PRF in Prokaryoten gleich. Bei der Suche nach Genen in Prokaryoten ist es einfach, einen ORF zu erkennen und ein Gen in Prokaryoten zu finden. Da in Eukaryoten Introns vorhanden sind, ist ORF die Codonsequenz, die sich nach Prozessierung oder RNA-Spleißen bildet. ORF ist ein Beweisstück, das die Genvorhersage unterstützt, solange ORF wahrscheinlich Teil eines Gens ist.
Was sind die Gemeinsamkeiten zwischen CDS und ORF?
- Bei Prokaryoten sind CDS und ORF gleich.
- Beide haben Startcodon und Stopcodon.
- Sie haben eine Anzahl von Nukleotiden, die durch drei teilbar sind.
- Nachdem sie übersetzt haben, produzieren sie Aminosäuresequenzen.
Was ist der Unterschied zwischen CDS und ORF?
CDS ist der eigentliche Teil des Gens, der in ein Protein übersetzt wird, während ORF der DNA-Abschnitt zwischen einem Startcodon und einem Stopcodon ist. Das ist also der Hauptunterschied zwischen CDS und ORF. Darüber hinaus enthält CDS keine Introns, aber ORF kann Introns enth alten. CDS transkribiert vollständig in eine vollständige mRNA-Sequenz, während ORF ein Teil der mRNA-Sequenz sein kann. Dies ist also ein weiterer Unterschied zwischen CDS und ORF.
Unten tabelliert die Infografik die Unterschiede zwischen CDS und ORF.
Zusammenfassung – CDS vs. ORF
CDS und ORF sind zwei wichtige Teile eines Gens. CDS bezieht sich auf die tatsächliche DNA-Region, die in ein Protein übersetzt wird. ORF ist eine DNA-Sequenz, die mit dem Startcodon „ATG“beginnt und mit einem der drei Terminationscodons (TAA, TAG oder TGA) endet. ORF kann ein Teil der vollständigen mRNA eines Gens sein. Die codierende Sequenz eines Gens wird jedoch in eine vollständige mRNA-Sequenz transkribiert. Alle CDS sind ORFs. Aber nicht alle ORFs sind CDSs. Somit fasst dies den Unterschied zwischen CDS und ORF zusammen.
