Was ist der Unterschied zwischen Isoschizomeren und Neoschizomeren?

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Was ist der Unterschied zwischen Isoschizomeren und Neoschizomeren?
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Anonim

Der Hauptunterschied zwischen Isoschizomeren und Neoschizomeren besteht darin, dass Isoschizomere Restriktionsenzyme sind, die dieselbe Erkennungssequenz haben und die DNA an denselben Positionen sp alten, während Neoschizomere Restriktionsenzyme sind, die dieselbe Erkennungssequenz haben, aber DNA an verschiedenen Positionen sp alten.

Restriktionsenzyme oder Restriktionsendonucleasen sind Enzyme, die DNA an oder in der Nähe spezifischer Erkennungsstellen in Fragmente sp alten. Sie schneiden DNA an Restriktionsstellen. Restriktionsenzyme werden normalerweise in fünf Gruppen eingeteilt, basierend auf ihrer Struktur, ob sie ihr DNA-Substrat an ihrer Erkennungsstelle schneiden und ob Erkennungs- und Sp altstelle voneinander getrennt sind. Mehr als 3600 Restriktionsendonucleasen wurden bereits identifiziert. Etwa 800 Restriktionsenzyme sind im Handel erhältlich. Isoschizomere und Neoschizomere sind zwei Arten von Restriktionsenzymen, basierend auf der Erkennungsstelle und der Sp altungsspezifität.

Was sind Isoschizomere?

Isoschizomere sind Restriktionsenzyme, die die gleiche Erkennungssequenz haben und die DNA an den gleichen Positionen sp alten. Diese Restriktionsenzyme haben die gleiche Spezifität. Das erste entdeckte Restriktionsenzym, das eine bestimmte Sequenz erkennt, wird als Prototyp bezeichnet, während alle nachfolgend identifizierten Restriktionsenzyme, die dieselbe Sequenz erkennen, als Isoschizomere bezeichnet werden. Isoschizomere können sich jedoch in Standortpräferenzen, Reaktionsbedingungen, Methylierungsempfindlichkeit und Sternaktivität unterscheiden. Isoschizomere werden aus verschiedenen Bakterienstämmen isoliert. Daher können sie unterschiedliche Reaktionsbedingungen erfordern. In einigen Fällen kann nur eines von zwei Isoschizomeren sowohl methylierte als auch unmethylierte Formen von Restriktionsstellen erkennen. Andererseits kann das andere Restriktionsenzym nur die unmethylierte Form der Restriktionsstelle erkennen. Dieses besondere Merkmal von Isoschizomeren hilft bei der Identifizierung des Methylierungszustands der Restriktionsstelle, während sie von einem bakteriellen Zustand isoliert wird.

Zum Beispiel erkennen und sp alten AgeI und BshT1 5’-A↓CCGGT in demselben Muster. HpaII und MSPI sind andere Paare von Isoschizomeren. Beide erkennen die Sequenz 5’-C↓CGG-3’, wenn sie nicht methyliert ist. Aber wenn das zweite C der Sequenz methyliert ist, kann nur MSPI diese Sequenz erkennen, während HpaII sie nicht erkennen kann.

Was sind Neoschizomere?

Neoschizomere sind Restriktionsenzyme, die die gleiche Erkennungssequenz haben, aber DNA an unterschiedlichen Positionen sp alten. Bei einigen speziellen molekularbiologischen Anwendungen ist dies ein sehr hilfreiches Feature. Die Neoschizomere sind eine Untergruppe der Isoschizomere. Bekannte Beispiele für Neoschizomere sind SmaI (5’-CCC↓GGG-3’) und XmaI (5’-C↓CCGGG-3’); beide erkennen die 5'-CCCGGG-3'-Sequenz, sp alten sie aber an einer anderen Position. Somit erzeugen diese beiden Restriktionsenzyme unterschiedliche Arten von Enden. In diesem Fall erzeugt SmaI stumpfe Enden und XmaI erzeugt 5’ hervorstehende Enden.

Isoschizomere vs. Neoschizomere in tabellarischer Form
Isoschizomere vs. Neoschizomere in tabellarischer Form

Abbildung 01: Neoschizomere

Ein weiteres Beispiel ist das Paar der Restriktionsenzyme MaeII und Tail. Der Prototyp MaeII (A↓CGT) produziert DNA-Fragmente mit einer 2-Basen-5'-Erweiterung, und der Neoschizomer-Schwanz (ACGT↓) produziert DNA-Fragmente mit einer 4-Basen-3'-Erweiterung.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Isoschizomeren und Neoschizomeren?

  • Isoschizomere und Neoschizomere sind zwei Arten von Restriktionsenzymen.
  • Sie kommen überwiegend in Prokaryoten vor.
  • Sie sind Teil des Restriktions-Modifikations-Systems (RM), das in Bakterien und Archaeen vorkommt.
  • Beide sind Eiweißmoleküle.
  • Beide sp alten DNA in Fragmente.

Was ist der Unterschied zwischen Isoschizomeren und Neoschizomeren?

Isoschizomere sind Restriktionsenzyme, die die gleiche Erkennungssequenz haben und die DNA an den gleichen Positionen sp alten, während Neoschizomere Restriktionsenzyme sind, die die gleiche Erkennungssequenz haben, aber die DNA an unterschiedlichen Positionen sp alten. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Isoschizomeren und Neoschizomeren. Darüber hinaus haben Isoschizomere die gleichen Spezifitäten, während Neoschizomere unterschiedliche Spezifitäten haben.

Die folgende Infografik listet die Unterschiede zwischen Isoschizomeren und Neoschizomeren in tabellarischer Form zum direkten Vergleich auf.

Zusammenfassung – Isoschizomere vs. Neoschizomere

Restriktionsenzyme sind DNA-schneidende Enzyme. Sie werden auch Molekularscheren genannt. Es gibt verschiedene Arten von Restriktionsenzymen. Basierend auf der Erkennungsstelle und der Sp altungsspezifität sind Restriktionsenzyme zwei Typen als Isoschizomere und Neoschizomere. Isoschizomere haben die gleiche Erkennungssequenz und sp alten die DNA an den gleichen Positionen, während Neoschizomere die gleiche Erkennungssequenz haben, aber die DNA an unterschiedlichen Positionen sp alten. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Isoschizomeren und Neoschizomeren.

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