Der Hauptunterschied zwischen Linker und Adapter besteht darin, dass ein Linker keine kohäsiven Enden hat, während ein Adapter ein kohäsives Ende hat.
DNA-Ligation ist der Prozess, bei dem zwei DNA-Moleküle miteinander verbunden werden, wodurch Phosphodiester-Bindungen gebildet werden. Das Enzym namens DNA-Ligase katalysiert diese Reaktion. Es ist einer der entscheidenden Schritte in modernen molekularbiologischen Bereichen wie der rekombinanten DNA-Technologie und dem DNA-Klonen. Die Ligationseffizienz hängt von den Enden der zu ligierenden DNA-Moleküle ab. Es gibt zwei Arten von DNA-Enden als klebrige Enden und stumpfe Enden. Die Ligationseffizienz ist bei klebrigen Enden höher als bei stumpfen Enden. Wenn die Ziel-DNA-Moleküle stumpfe Enden haben, sind Moleküle, die Adapter oder Linker genannt werden, nützlich. Adapter und Linker sind chemisch synthetisierte Oligonukleotidmoleküle, die bei der DNA-Ligation helfen. Sie haben auch interne Restriktionsstellen. Der Adapter hat ein klebriges und ein stumpfes Ende, während der Linker zwei stumpfe Enden hat.
Was ist ein Linker?
Linker ist eine chemisch synthetisierte Oligonukleotidsequenz, die doppelsträngig ist. Linker hat zwei stumpfe Enden. Linker werden verwendet, um DNA-Moleküle mit stumpfen Enden an Vektoren zu ligieren. Es enthält eine oder mehrere interne Restriktionsstellen. Diese Restriktionsstellen dienen als Erkennungsstellen für Restriktionsenzyme.
Abbildung 01: Linker
Nach der Ligation wird die DNA erneut mit Restriktionsenzymen restringiert, um kohäsive Enden zu erzeugen. EcoRI-Linker und Sal-I-Linker sind häufig verwendete Linker.
Was ist ein Adapter?
Ein Adapter ist eine doppelsträngige Oligonukleotidsequenz, die verwendet wird, um zwei DNA-Moleküle miteinander zu verbinden. Es ist eine kurze Sequenz mit einem stumpfen Ende und einem klebrigen oder kohäsiven Ende. Daher besteht es aus einem einzelsträngigen Schwanz an einem Ende, was die Effizienz der DNA-Ligation erhöht.
Abbildung 02: DNA-Ligation durch einen Adapter
Außerdem hat der Adapter interne Restriktionsstellen. Daher kann die DNA nach der Ligation mit geeigneten Restriktionsenzymen restringiert werden, um einen neuen vorstehenden Terminus zu erzeugen. Ein Nachteil von Adaptern ist, dass zwei Adapter durch Basenpaarung mit sich selbst Dimmer bilden können. Dies kann vermieden werden, indem man sie mit dem Enzym alkalische Phosphatase behandelt.
Was sind die Gemeinsamkeiten zwischen Linker und Adapter?
- Sowohl Linker als auch Adapter sind doppelsträngige kurze Oligonukleotidsequenzen.
- Sie tragen interne Restriktionsstellen.
- Außerdem sind sie chemisch synthetisierte DNA-Moleküle und synthetische Moleküle.
- Sie können zwei DNA-Moleküle miteinander verknüpfen.
- Nach Ligation von Linkern und Adaptern wird die DNA erneut mit Restriktionsenzymen restringiert, um klebrige Enden zu erzeugen.
Was ist der Unterschied zwischen Linker und Adapter?
Ein Linker ist ein chemisch synthetisierter, kurzer Oligonukleotid-Duplex mit zwei stumpfen Enden. Ein Adapter ist ein chemisch synthetisierter, kurzer Oligonukleotid-Duplex mit einem klebrigen Ende und einem stumpfen Ende. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Linker und Adapter. Darüber hinaus können Adapter Dimere bilden, während Linker keine Dimere bilden. Dies ist also ein weiterer signifikanter Unterschied zwischen Linker und Adapter.
Im Folgenden finden Sie eine tabellarische Zusammenfassung der Unterschiede zwischen Linker und Adapter.
Zusammenfassung – Linker vs. Adapter
Linker und Adapter sind zwei Arten von chemisch synthetisierten Oligonukleotiden, die beim Ligieren von DNA mit stumpfen Enden nützlich sind. Linker hat zwei stumpfe Enden, während Adapter ein stumpfes Ende und ein kohäsives Ende hat. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Linker und Adapter. Sie sind doppelsträngige Moleküle mit internen Restriktionsstellen. Sie werden häufig in der rekombinanten DNA-Technologie und beim DNA-Klonen verwendet.
