Was ist der Unterschied zwischen DNA-Transposons und Retrotransposons?

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Was ist der Unterschied zwischen DNA-Transposons und Retrotransposons?
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Video: Transposons | Transposable elements | Types of transposons| how transposons work? 2024, Juli
Anonim

Der Hauptunterschied zwischen DNA-Transposons und Retrotransposons besteht darin, dass DNA-Transposons mobile genetische Elemente sind, die sich mithilfe eines Ausschneide- und Einfügemechanismus von einem Ort zum anderen im Genom bewegen, während Retrotransposons mobile genetische Elemente sind, die sich von einem Ort bewegen zu einem anderen im Genom, indem Sie den Kopier- und Einfügemechanismus verwenden.

Mobile genetische Elemente (MGEs) sind DNA-Segmente, die spezifische Enzyme und Proteine kodieren, die ihre Bewegung innerhalb des Genoms vermitteln oder die von einer Spezies auf eine andere übertragen werden können. Sie sind auch als egoistische genetische Elemente bekannt. Transponierbare Elemente stellen eine von mehreren Arten mobiler genetischer Elemente dar. Es gibt zwei Haupttypen von transponierbaren Elementen: DNA-Transposons und Retrotransposons. Daher sind DNA-Transposons und Retrotransposons mobile genetische Elemente, die sich im Genom von Ort zu Ort bewegen können.

Was sind DNA-Transposons?

DNA-Transposons sind mobile genetische Elemente, die sich im Genom durch Ausschneiden und Einfügen von einer Stelle zur anderen bewegen. Sie gehören zu den transponierbaren Elementen der Klasse II, die sich durch ein DNA-Zwischenprodukt bewegen. Dies steht im Gegensatz zu transponierbaren Elementen der Klasse I (Retrotransposons), die sich durch ein RNA-Zwischenprodukt bewegen. Normalerweise bewegen sich DNA-Transposons im Genom, indem sie eine Cut-and-Paste-Methode verwenden. Diese Methode erfordert ein Transposase-Enzym, das die Bewegung der DNA von ihrer aktuellen Position im Genom und die Insertion an der neuen Position katalysiert.

DNA-Transposons und Retrotransposons – Direktvergleich
DNA-Transposons und Retrotransposons – Direktvergleich

Abbildung 01: DNA-Transposons

Diese Transposition erfordert drei DNA-Stellen auf dem Transposon (zwei an jedem Ende des Transposons, die als terminale invertierte Wiederholungen bezeichnet werden, und eine an der Zielstelle). Das Transposase-Enzym bindet an die terminalen invertierten Wiederholungen des Transposons und vermittelt die Synapse der Transposon-Enden. Dann trennt das Transposase-Enzym das Element von der flankierenden DNA der ursprünglichen Spenderstelle und vermittelt die Verbindung des Transposons mit der neuen Insertionsstelle im Genom. Das Hinzufügen von Transposon an der neuen Position verursacht kurze Lücken auf beiden Seiten des eingefügten Segments. Wirtssysteme reparieren diese Lücken, was zur Zielsequenzduplikation (TSD) führt, die für die Transposition charakteristisch ist.

Was sind Retrotransposons?

Retrotransposons sind mobile genetische Elemente, die sich im Genom durch Kopieren und Einfügen von einer Stelle zur anderen bewegen. Sie gehören zu den transponierbaren Elementen der Klasse I. Transponierbare Elemente der Klasse I (Retrotransposons) bewegen sich durch ein RNA-Zwischenprodukt im Genom. Sie sind eine Art genetische Komponente, die sich selbst kopieren und an verschiedenen Stellen im Genom einfügen.

DNA-Transposons vs. Retrotransposons in tabellarischer Form
DNA-Transposons vs. Retrotransposons in tabellarischer Form

Abbildung 02: Retrotransposons

Zunächst werden sie von DNA zu RNA transkribiert. Dann wird die produzierte RNA revers in DNA transkribiert. Diese kopierte DNA wird später an einer neuen Stelle wieder in das Genom eingefügt. Die reverse Transkription wird durch reverse Transkriptase katalysiert. Reverse Transkriptase wird oft durch Retrotransposon selbst kodiert. Die Integration erfolgt durch ein Enzym namens Integrase. Darüber hinaus gibt es üblicherweise drei Typen: lange terminale Wiederholungen (LTR), lange eingestreute Kernelemente (LINE) und kurze eingestreute Kernelemente (SINE).

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen DNA-Transposons und Retrotransposons?

  • DNA-Transposons und Retrotransposons sind mobile genetische Elemente.
  • Beide gehören zu den transponierbaren Elementen.
  • Beide sind als springende Gene bekannt.
  • Sie können sich im Genom von Ort zu Ort bewegen.
  • Sie sind evolutionär sehr wichtig.

Was ist der Unterschied zwischen DNA-Transposons und Retrotransposons?

DNA-Transposons sind mobile genetische Elemente, die sich im Genom von einem Ort zum anderen bewegen, indem sie einen Ausschneide- und Einfügemechanismus verwenden, während Retrotransposons mobile genetische Elemente sind, die sich im Genom von einem Ort zum anderen bewegen, indem sie eine Kopie verwenden und Mechanismus einfügen. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen DNA-Transposons und Retrotransposons. Darüber hinaus gehören DNA-Transposons zu transponierbaren Elementen der Klasse II, während Retrotransposons zu transponierbaren Elementen der Klasse I gehören.

Die folgende Infografik zeigt die Unterschiede zwischen DNA-Transposons und Retrotransposons in tabellarischer Form zum direkten Vergleich.

Zusammenfassung – DNA-Transposons vs. Retrotransposons

DNA-Transposons und Retrotransposons sind mobile genetische Elemente. DNA-Transposons bewegen sich im Genom von einer Stelle zur anderen, indem sie einen Cut-Paste-Mechanismus verwenden. Retrotransposons bewegen sich im Genom von einer Stelle zur anderen, indem sie einen Kopier- und Einfügemechanismus verwenden. Das fasst also den Unterschied zwischen DNA-Transposons und Retrotransposons zusammen.

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