Der Hauptunterschied zwischen MLVA und MLST besteht darin, dass MLVA den Polymorphismus von tandemartig wiederholten DNA-Sequenzen verwendet, um mikrobielle Arten zu charakterisieren, während MLST den Polymorphismus von DNA-Sequenzen interner Fragmente mehrerer Haush altsgene verwendet, um mikrobielle Arten zu charakterisieren.
Mikrobielle Typisierung wird normalerweise verwendet, um die Quelle und die Wege von Infektionen zu bestimmen. Es bestätigt oder schließt Ausbrüche aus. Die mikrobielle Typisierung verfolgt auch die Kreuzübertragung von mit dem Gesundheitswesen assoziierten Krankheitserregern und erkennt virulente Stämme. Darüber hinaus bewertet die mikrobielle Typisierung die Wirksamkeit von Kontrollmaßnahmen gegen pathogene mikrobielle Arten. MLVA und MLST sind zwei molekularbiologische Techniken, die bei der mikrobiellen Typisierung verwendet werden.
Was ist MLVA?
Multiple loci VNTR analysis (MLVA) ist eine molekularbiologische Methode, die den Polymorphismus von tandemartig wiederholten DNA-Sequenzen nutzt, um mikrobielle Spezies zu charakterisieren. Es ist eine Methode zur genetischen Analyse bestimmter mikrobieller Arten.
Während des ersten Schritts von MLVA wird jeder gezielte VNTR-Lokus durch PCR mit flankierenden regionspezifischen Primern amplifiziert. Dann werden die erh altenen Fragmente durch Elektrophorese auf einem Kapillarsequenzer nach Größe getrennt. Die Genotypisierung jedes Locus und die aus jeder Probe zusammengestellten Ergebnisse ermöglichen die Charakterisierung eines Mikroorganismus, dessen Art bekannt ist. Es ermöglicht auch die Identifizierung der Unterart durch Alleltypisierung und Vergleich mit den MLVA-Datenbanken.
Abbildung 01: MLVA
Diese MLVA-Methode ist selektiver als die MLST-Methode. Darüber hinaus erfordert das MLVA-Verfahren keinen DNA-Sequenzierungsschritt. Dadurch ist es möglich, nahe Unterarten oder klonale Arten zu unterscheiden.
Was ist MLST?
Multilocus Sequence Typing (MLST) ist eine Technik, die den Polymorphismus von DNA-Sequenzen interner Fragmente mehrerer Haush altsgene nutzt, um mikrobielle Arten zu charakterisieren. MLST ist eine Technik in der genetischen Analyse zur Typisierung mehrerer Loci.
Abbildung 02: MLST
Es ist eine Art Sequenztypisierung, die als Referenztechnik verwendet wird, um verschiedene Stämme mikrobieller Arten zu unterscheiden. Diese Methode basiert auf der Sequenzierung von Housekeeping-Genen. Die Haush altsgene kodieren normalerweise für essentielle Proteine mikrobieller Mittel wie Bakterien. Diese Sequenzen von Haush altsgenen haben die Besonderheit, dass sie im Laufe der Zeit einen stabilen Polymorphismus aufweisen. Daher reichen die Unterschiede in den Sequenzen der Haush altsgene aus, um Stämme voneinander zu unterscheiden. Darüber hinaus war das erste MLST-Schema, das entwickelt wurde, Neisseria meningitidis, der Erreger von Meningokokken-Meningitis und Blutvergiftung. Seit seiner Einführung wird MLST nicht nur für humanpathogene, sondern auch für pflanzenpathogene eingesetzt.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen MLVA und MLST?
- MLVA und MLST sind zwei molekularbiologische Techniken, die bei der mikrobiellen Typisierung verwendet werden.
- Beide Techniken können für die mikrobielle phylogenetische Analyse verwendet werden.
- Beide Techniken basieren auf genetischem Polymorphismus.
- Sie können zum Nachweis menschlicher Krankheiten verwendet werden, die mikrobielle Krankheitserreger verursachen.
- Beide Techniken sollten von erfahrenen Molekularbiologen durchgeführt werden.
Was ist der Unterschied zwischen MLVA und MLST?
MLVA ist eine Technik, die den Polymorphismus von tandemartig wiederholten DNA-Sequenzen nutzt, um mikrobielle Arten zu charakterisieren. Inzwischen ist MLST eine Technik, die den Polymorphismus von DNA-Sequenzen interner Fragmente mehrerer Haush altsgene nutzt, um mikrobielle Arten zu charakterisieren. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen MLVA und MLST. Außerdem ist die MLVA-Methode selektiver als die MLST-Methode.
Die folgende Infografik zeigt die Unterschiede zwischen MLVA und MLST in tabellarischer Form für einen direkten Vergleich.
Zusammenfassung – MLVA vs. MLST
MLVA und MLST sind zwei molekularbiologische Techniken, die bei der mikrobiellen Typisierung verwendet werden. MLVA verwendet den Polymorphismus von tandemartig wiederholten DNA-Sequenzen, um mikrobielle Arten zu charakterisieren, während MLST den Polymorphismus von DNA-Sequenzen interner Fragmente mehrerer Haush altsgene verwendet, um mikrobielle Arten zu charakterisieren. Das ist also der Hauptunterschied zwischen MLVA und MLST.
