Unterschied zwischen konservierter und Consensus-Sequenz

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Unterschied zwischen konservierter und Consensus-Sequenz
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Anonim

Der Hauptunterschied zwischen konservierter und Konsensussequenz besteht darin, dass sich konservierte Sequenzen auf ähnliche Sequenzen von Nukleinsäuren oder Aminosäuren beziehen, die in verschiedenen oder gleichen Arten über Generationen hinweg vorkommen, während die Konsensussequenz eine häufig vorkommende Nukleotidsequenz oder gefundene Aminosäuresequenz ist in einer hoch konservierten Region von DNA oder RNA oder Protein.

Organismen haben sowohl ähnliche als auch unterschiedliche Eigenschaften. Bei der Untersuchung der Beziehungen zwischen Organismen und deren Klassifizierung ist das Genom oder die genetische Ausstattung von Organismen sehr wichtig. Es gibt einige Nukleotid- oder Aminosäuresequenzen, die verschiedenen Organismen gemeinsam sind. Eine konservierte Sequenz ist eine Nukleinsäure- oder Aminosäuresequenz, die unter Arten konsistent ist. Daher sind sie phylogenetisch wichtig bei der Erstellung von Stammbäumen. In konservierten Sequenzen gibt es spezifische Nukleotidsequenzen, die häufiger gefunden werden. Sie sind als Konsensussequenzen bekannt.

Was ist eine konservierte Sequenz?

Eine konservierte Sequenz ist eine Nukleinsäuresequenz oder Aminosäuresequenz, die zwischen Spezies ähnlich ist. Daher ist es während der gesamten Evolution über die Arten hinweg konsistent. Im Allgemeinen werden diese Sequenzen durch natürliche Selektion aufrechterh alten. Sie bleiben weit hinten im Stammbaum unverändert. Daher sind konservierte Sequenzen bei der Konstruktion phylogenetischer Bäume wichtig. Es wird angenommen, dass hochkonservierte Sequenzen oft einen wichtigen funktionellen Wert haben. Sie sind auch nützlich, um genetische Krankheiten zu identifizieren. Konservierte Sequenzen können jedoch codierende oder nicht codierende Nukleinsäuresequenzen sein. Außerdem zeigen konservierte Sequenzen langsamere Mutationsraten. Daher zeigen sie sehr minimale Änderungen in ihrer Zusammensetzung; manchmal zeigen sie keine Veränderungen über die Generationen hinweg.

Unterschied zwischen konservierter und Consensus-Sequenz
Unterschied zwischen konservierter und Consensus-Sequenz

Abbildung 01: Konservierte Sequenz

RNA-Komponenten von Ribosomen sind in allen Bereichen des Lebens vorhanden, die Homöobox-Sequenzen in Eukaryoten und die tmRNA in Bakterien sind einige Beispiele für hochkonservierte Sequenzen. Die Identifizierung konservierter Sequenzen ist einfach, wenn bioinformatische Ansätze, insbesondere das Sequenzalignment-Tool, verwendet werden. Darüber hinaus erleichtert multiples Sequenz-Alignment die Visualisierung konservierter Sequenzen.

Was ist die Konsenssequenz?

Eine Konsensussequenz ist eine Sequenz, die üblicherweise in einer bestimmten konservierten Region von DNA oder RNA gefunden wird. Es ist eine sehr spezifische Nukleotidsequenz. Als Beispiel gibt es eine Consensus-Sequenz bei -10 als TATAAT (Pribnow-Box) in E. coli-Promotoren, die hochgradig konservierte Sequenzen sind. In ähnlicher Weise gibt es eine andere Consensus-Sequenz: TTGACA in E. coli-Promotoren auch bei -35. Konsenssequenzen werden auch als „Boxen“bezeichnet.

Hauptunterschied - Konservierte vs. Consensus-Sequenz
Hauptunterschied - Konservierte vs. Consensus-Sequenz

Abbildung 02: Konsenssequenz

Proteine haben neben DNA und RNA auch Consensus-Sequenzen von Aminosäuren. Proteinbindungsstellen werden häufig durch Konsensussequenzen dargestellt. Restriktionsenzyme haben auch Consensus-Sequenzen. Darüber hinaus sind Spleißstellen auch Konsensussequenzen. Ähnlich wie konservierte Sequenzen können Konsensussequenzen durch Bioinformatik-Tools berechnet und visualisiert werden.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen konservierter und Consensus-Sequenz?

  • Konservierte und Consensus-Sequenzen sind Nukleinsäure- oder Aminosäuresequenzen, die über Arten hinweg vorkommen.
  • Sowohl konservierte als auch Consensus-Sequenzen können durch Bioinformatik-Tools visualisiert werden.
  • Sie sind in der Molekularbiologie weit verbreitet.

Was ist der Unterschied zwischen konservierter und Consensus-Sequenz?

Die konservierte Sequenz ist eine Nukleinsäure- oder Aminosäuresequenz, die zwischen den Arten konsistent ist, während Konsensussequenzen sehr spezifische und häufig vorkommende Basen oder Aminosäuren in einer bestimmten konservierten Region sind. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen konservierter und Konsensussequenz. Darüber hinaus besteht ein weiterer Unterschied zwischen konservierten und Konsensussequenzen darin, dass die konservierten Sequenzen phylogenetisch wichtig sind, während Konsensussequenzen häufig Proteinbindungsstellen, Spleißstellen, Schnittstellen von Restriktionsenzymen usw. sind.

Unterschied zwischen konservierter und Consensus-Sequenz in tabellarischer Form
Unterschied zwischen konservierter und Consensus-Sequenz in tabellarischer Form

Zusammenfassung – Sequenz Konserviert vs. Konsens

Konservierte Sequenzen sind Sequenzen von Nukleinsäuren oder Proteinen, die bei lebenden Arten ähnlich sind. Ein Promotor, eine Ribosomenbindungsstelle, ein Replikationsursprung und eine Aminosäuresequenz eines Histonproteins sind einige Beispiele für konservierte Sequenzen. Im Gegensatz dazu sind Consensus-Sequenzen spezifische Basen oder Aminosäuren, die häufiger in einer gegebenen konservierten Sequenz gefunden werden. -10-Box, -35-Box des E. coli-Promotors, Proteinbindungsstellen, Spleißstellen und Restriktionsenzym-Erkennungsstellen sind einige Beispiele für Consensus-Sequenzen. Dies ist also die Zusammenfassung des Unterschieds zwischen konservierter und Consensus-Sequenz.

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