Der Hauptunterschied zwischen DNA- und RNA-Sonden besteht darin, dass DNA-Sonden DNA-Fragmente sind, die zu Ziel-Nukleotidsequenzen komplementär sind, während RNA-Sonden Abschnitte einzelsträngiger RNA sind, die komplementäre Nukleinsäuresequenzen von Zielsequenzen sind.
Eine Sonde ist eine künstlich synthetisierte kurze DNA- oder RNA-Sequenz, die radioaktiv oder mit nicht radioaktiven Molekülen markiert werden kann. Es kann eine Länge von 100 bis 1000 Basen aufweisen. Sonden sind nützlich beim Nachweis von Zielnukleotidsequenzen, die komplementär zu der Sequenz der Sonde sind. Einmal hinzugefügte Sonden werden mit den komplementären Sequenzen oder den Zielsequenzen hybridisiert und machen sie sichtbar, um die Zielsequenzen zu identifizieren, da sie Radioaktivität tragen. Sonden sind wichtige molekulare Werkzeuge für viele mikrobielle und molekulare Bereiche wie den Nachweis genetischer Krankheiten, in der Virologie, in der forensischen Pathologie, bei Vaterschaftstests, beim DNA-Fingerabdruck, RFLP, molekularer Zytogenetik, In-situ-Hybridisierung usw.
Was sind DNA-Sonden?
DNA-Sonden sind einzelsträngige DNA-Abschnitte. Sie können verwendet werden, um das Vorhandensein von komplementären Nukleinsäuresequenzen (Zielsequenzen) durch Hybridisierung nachzuweisen. Sobald eine DNA-Sonde mit ihrer komplementären Sequenz hybridisiert, bildet sie ein doppelsträngiges Hybrid. Um sie nachzuweisen, werden DNA-Sonden im Allgemeinen mit Radioisotopen, Biotin, Epitopen oder Fluorophoren markiert. Die mit Biotin markierten DNA-Sonden können mit Streptavidin-markierter alkalischer Phosphatase durch eine Reihe von enzymatischen und chemischen Methoden nachgewiesen werden.
Abbildung 01: DNA-Sonde
Die Nukleotidsequenz der DNA-Sonde ist bekannt. Es sind kurze Sequenzen mit einer Länge von 100 bis 1000 Basenpaaren. Lange DNA-Sonden können durch rekombinante DNA-Technologie erzeugt werden. Sie können auch durch PCR und Klonierung erzeugt werden. In klinisch-mikrobiologischen Labors sind DNA-Sonden für die schnelle Diagnose von Infektionskrankheiten leicht verfügbar.
Was sind RNA-Sonden?
RNA-Sonden sind einzelsträngige RNA-Abschnitte. Sie sind komplementäre Sequenzen zu Zielsequenzen in der Probe. Sie werden üblicherweise mit den RNA-Polymerasen der Bakteriophagen SP6, T7 oder T3 durch In-vitro-Transkription von DNA synthetisiert. Lange RNA-Sonden können durch In-vitro-Transkription aus linearisierter Plasmid-DNA erzeugt werden. Im Allgemeinen binden RNA-Sonden stark und fester an ihre komplementären Sequenzen als DNA-Sonden. Ähnlich wie DNA-Sonden können auch RNA-Sonden markiert werden, während sie transkribiert werden.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen DNA- und RNA-Sonden?
- Sowohl DNA- als auch RNA-Sonden sind einzelsträngige Nukleotidsequenzen.
- Beide sind künstlich entworfen und synthetisiert.
- Außerdem können sie mit Radioisotopen, Epitopen, Biotin oder Fluorophoren markiert werden.
- Sie haben eine starke Affinität zu einer bestimmten DNA- oder RNA-Zielsequenz.
- Sie werden in verschiedenen Blotting- und In-situ-Hybridisierungstechniken zum Nachweis von Zielnukleinsäuresequenzen verwendet.
- Beide Arten von Sonden können mit ihren komplementären Sequenzen hybridisiert werden.
- Sie werden auch zur Identifizierung von Mikroorganismen und zur Diagnose von Infektions-, Erb- und anderen Krankheiten verwendet.
Was ist der Unterschied zwischen DNA- und RNA-Sonden?
DNA-Sonde ist ein kurzer DNA-Abschnitt, der komplementär zur Zielsequenz ist. Andererseits ist die RNA-Sonde ein kurzer einzelsträngiger RNA-Abschnitt, der zur Zielsequenz komplementär ist. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen DNA- und RNA-Sonden. Darüber hinaus enth alten DNA-Sonden A, T, C und G, während RNA-Sonden A, U, C und G enth alten.
Darüber hinaus besteht ein weiterer Unterschied zwischen DNA- und RNA-Sonden in ihrer thermodynamischen Stabilität. RNA-Sonden weisen im Vergleich zu DNA-Sonden eine größere thermodynamische Stabilität auf.
Die folgende Infografik listet die wichtigen Unterschiede zwischen DNA- und RNA-Sonden auf.
Zusammenfassung – DNA vs. RNA-Sonden
Eine Sonde ist ein kleines DNA- oder RNA-Fragment, das verwendet wird, um das Vorhandensein einer spezifischen Sequenz in der DNA- oder RNA-Probe durch molekulare Hybridisierung nachzuweisen. DNA-Sonden sind kurze einzelsträngige DNA-Fragmente, während RNA-Sonden kurze einzelsträngige RNA-Sequenzen sind. Sie sind bekannte Sequenzen. Die thermodynamische Stabilität ist bei RNA-Sonden größer als bei DNA-Sonden. RNA-Sonden binden fester an ihre komplementären Sequenzen als DNA-Sonden binden. Somit fasst dies den Unterschied zwischen DNA- und RNA-Sonden zusammen.
