Der Hauptunterschied zwischen LINEs und SINEs besteht darin, dass LINEs (long interspersed Nuclear Elements) eine Art längerer Nicht-LTR-Retrotransposons sind, während SINEs (short interspersed Nuclear Elements) eine Art viel kürzerer Nicht-LTR-Retrotransposons sind.
Non-LTR-Retrotransposons enth alten keine Long Terminal Repeats (LTR). Sie enth alten jedoch Gene für reverse Transkriptase, RNA-Bindungsprotein, Nuklease und Ribonuklease-H-Domäne. Nicht-LTR-Retrotransposons haben kurze Wiederholungen. Diese Wiederholungen haben eine umgekehrte Anordnung von Basen nebeneinander. Abgesehen davon haben Nicht-LTR-Retrotransposons auch direkte Wiederholungen, die in LRT-Transposons gefunden werden. Nicht-LTR-Retrotransposons fallen in zwei Kategorien als LINEs und SINEs.
Was sind LINES?
LINEs (lange eingestreute Kernelemente) sind längere Nicht-LTR-Retrotransposons. Sie sind im Genom von Eukaryoten weit verbreitet. Sie machen normalerweise 21,1 % des menschlichen Genoms aus. Jede LINIE ist etwa 7000 Basenpaare lang. LINEs können in mRNA transkribieren und in ein Protein übersetzen, das als Reverse-Transkriptase-Enzym fungieren kann. Diese reverse Transkriptase produziert DNA-Kopien der LINEs-RNA. Diese DNA-Kopien können an einer neuen Stelle in das Genom integriert werden.
Abbildung 01: LINIEN und SINUS
Das menschliche Genom hat nur eine reichlich vorhandene LINIE namens LINIE-1. Das LINE-1-Element ist etwa 6000 Basenpaare lang. Es gibt etwa 100.000 verkürzte LINE-1-Elemente im menschlichen Genom. Zufällige Mutationen können in LINEs auftreten. Aufgrund zufälliger Mutationen können die LINEs degenerieren. Sie werden nicht mehr transkribiert oder übersetzt. Darüber hinaus werden LINEs in fünf Hauptgruppen wie L1, RTE, R2, I und Jockey eingeteilt. Diese fünf Gruppen unterteilen sich weiter in weitere 28 Kladen.
LINEs werden normalerweise durch einen Mechanismus verbreitet, der als Target-Primed-Reverse-Transkription-Mechanismus (TPRT) bezeichnet wird. Das Einfügen von LINEs verursacht beim Menschen Krankheiten wie Hämophilie A, Krebs, Mendelsche Störungen usw. Die Hypomethylierung von LINEs löst auch bestimmte Krebsarten aus.
Was sind SINE?
SINEs (Short Interspersed Nuclear Elements) sind eine Art von viel kürzeren Nicht-LTR-Retrotransposons. Sie sind etwa 100 bis 700 Basenpaare lang. SINEs sind auch DNA-Elemente, die sich selbst durch eukaryotische Genome durch RNA-Zwischenprodukte amplifizieren. SINEs machen etwa 13 % des Säugetiergenoms aus. Die internen Regionen von SINEs stammen von tRNA. Es bleibt hoch konserviert. Sie sind oft in vielen Arten von Wirbeltieren und Wirbellosen vorhanden. Die Variation der Kopienzahl und Mutationen in den SINEs können einbezogen werden, um die Phylogenie-basierte Klassifizierung von Arten zu erstellen.
SINEs können in drei Haupttypen eingeteilt werden: CORE-SINEs, V-SINEs und AmnSINEs. Das Alu-Element ist der häufigste SINE bei Primaten. Darüber hinaus gibt es mehr als 50 menschliche Krankheiten, die mit dem Einfügen von SINEs in Verbindung gebracht werden. Wenn sie innerhalb oder in der Nähe von Exons eingefügt werden, können sie ein unsachgemäßes Spleißen verursachen oder den Leserahmen verändern. Dies führt zu Krankheitsphänotypen wie Brustkrebs, Dickdarmkrebs, Leukämie, Hämophilie, Mukoviszidose, Dickdarmkrebs, Morbus Dent, Neurofibromatose usw.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen LINES und SINUS?
- LINEs und SINEs sind zwei Arten von Nicht-LTR-Retrotransposons.
- Beide haben keine langen Endregionen (LTR).
- Beide kommen überwiegend nur in Eukaryoten vor.
- Sie sind beide nicht autonom.
Was ist der Unterschied zwischen LINES und SINUS?
LINEs sind längere Nicht-LTR-Retrotransposons, während SINEs viel kürzere Nicht-LTR-Retrotransposons sind. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen LINEs und SINEs. Darüber hinaus kodiert LINES für das Reverse-Transkriptase-Enzym, während SINE nicht für das Reverse-Transkriptase-Enzym kodiert. Dies ist also ein weiterer Unterschied zwischen LINEs und SINEs.
Weitere Unterschiede zwischen LINEs und SINEs sind unten in tabellarischer Form zum direkten Vergleich aufgelistet.
Zusammenfassung – LINIEN vs. SINUS
Retrotransposons kommen hauptsächlich in allen Eukaryoten vor, fehlen aber in Prokaryoten. Etwa 37 % des menschlichen Genoms enth alten Retrotransposons. Retrotransposons sind hauptsächlich zwei Typen: LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons. Nicht-LTR-Retrotransposons enth alten keine langen terminalen Wiederholungen (LTR), die in LTR-Retrotransposons vorhanden sind. Nicht-LTR-Retrotransposons werden weiter in zwei Kategorien unterteilt: LINEs und SINEs. LINEs sind längere Nicht-LTR-Retrotransposons, während SINEs viel kürzere Nicht-LTR-Retrotransposons sind. Dies ist also die Zusammenfassung des Unterschieds zwischen LINEs und SINEs.
