Der Hauptunterschied zwischen Agarose- und Polyacrylamidgelelektrophorese besteht darin, dass bei der Agarosegelelektrophorese horizontal gegossene Agarosegele verwendet werden, um vergleichsweise größere DNA-Fragmente zu trennen, während bei der Polyacrylamidgelelektrophorese vertikal gegossene Polyacrylamidgele verwendet werden, um kürzere Nukleinsäurefragmente zu trennen.
Elektrophorese ist eine Art von Technik, die ein elektrisches Feld verwendet, das über eine Gelmatrix angelegt wird, um Biomoleküle wie DNA, RNA und Proteine zu trennen. Diese Trennung von Biomolekülen wie DNA, RNA und Proteinen durch Elektrophorese basiert auf Ladung und Größe. Proben werden in die Vertiefungen des Gels geladen. Später wird das elektrische Feld über das Gel angelegt. Das Feld bewirkt, dass sich negativ geladene Moleküle in Richtung der positiven Elektrode bewegen. Die Gelmatrix fungiert als Molekularsieb, durch das die kleinsten Moleküle schnell passieren oder sich schnell bewegen, während sich größere Moleküle langsam bewegen. Dies ermöglicht die Trennung von Molekülen nach Ladung und Größe. Daher sind Agarose- und Polyacrylamidgelelektrophorese zwei Arten von Gelelektrophoresetechniken, die hauptsächlich dabei helfen, Moleküle basierend auf ihrer Größe und Ladung zu trennen.
Was ist Agarose-Gelelektrophorese?
Agarosegelelektrophorese ist eine Technik, die Agarosegele verwendet, um Biomoleküle wie DNA und RNA zu trennen. Es ist eine Technik, die verwendet wird, um Nukleinsäuren hauptsächlich nach Größe zu trennen. Die Hauptverbindung namens Agarose, die bei dieser Technik verwendet wird, ist ein Polysaccharid. Es stammt aus Algen. Agarose kann in kochendem Puffer gelöst und dann in eine horizontal geh altene Schale gegossen werden. In der Schale verfestigt es sich beim Abkühlen zu einer Platte. Agarosegele werden mit einem Kamm gegossen, um Vertiefungen herzustellen, in die Nukleinsäuren wie DNA oder RNA geladen werden, sobald sich das Gel verfestigt hat.
Abbildung 01: Agarose-Gelelektrophorese
Das Gel wird später in einen geeigneten Puffer eingetaucht und ein Strom wird über das Gel angelegt. DNA hat eine einheitliche negative Ladung, die unabhängig von der Sequenzzusammensetzung des Moleküls ist. Daher wandern DNA-Moleküle von der Kathode (-) zur Anode (+). Die Migrationsgeschwindigkeit hängt direkt von der Größe des Moleküls ab. Die größten Makromoleküle haben es am schwersten, durch das Gel zu navigieren. Andererseits schlüpfen die kleineren Makromoleküle schnell und ziemlich leicht durch das Gel.
Was ist Polyacrylamid-Gelelektrophorese?
Polyacrylamid-Gelelektrophorese (PAGE) ist eine Technik, die Polyacrylamid-Gele verwendet, um Biomoleküle abzutrennen. Es ist eine Technik, die weit verbreitet ist, um biologische Makromoleküle, normalerweise Proteine und Nukleinsäuren, entsprechend ihrer elektrophoretischen Mobilität zu trennen. Die Hydratation von Acrylnitril führt zur Bildung von Acrylamidmolekülen durch Nitrilhydratase. Acrylamid ist wasserlöslich und bei Zugabe von Radikalstartern polymerisiert Acrylamid, was zur Bildung von Polyacrylamidgel führt. Normalerweise führen erhöhte Konzentrationen von Acrylamid zu einer verringerten Porengröße im Gel. Polyacrylamidgele werden im Gegensatz zu Agarosegelen vertikal gegossen.
Abbildung 02: Polyacrylamid-Gelelektrophorese
Bei der Polyacrylamid-Gelelektrophorese können die Moleküle in ihrem nativen Zustand laufen, wodurch die Struktur höherer Ordnung von Molekülen erh alten bleibt. Diese Methode wird native PAGE genannt. Alternativ kann auch ein chemisches Denaturierungsmittel hinzugefügt werden, um die Struktur höherer Ordnung zu entfernen und das Molekül in ein unstrukturiertes Molekül zu verwandeln, dessen Mobilität nur von seiner Länge abhängt. Dieser Typ wird SDS-PAGE genannt.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Agarose und Polyacrylamid-Gelelektrophorese?
- Agarose- und Polyacrylamid-Gelelektrophorese sind zwei Arten von Gelelektrophoresetechniken.
- Tatsächlich handelt es sich um molekularbiologische Techniken.
- Beide Techniken werden verwendet, um biologische Makromoleküle wie DNA und Proteine nachzuweisen.
- Diese Techniken werden von erfahrenen Technikern oder Forschern durchgeführt.
- Bei beiden Techniken basiert die Trennung von Makromolekülen auf der Ladung und der Größe.
- Beide Techniken ermöglichen die Trennung von Nukleinsäuren wie DNA und RNA.
Was ist der Unterschied zwischen Agarose- und Polyacrylamid-Gelelektrophorese?
Agarosegelelektrophorese ist eine Technik, die horizontal gegossene Agarosegele verwendet, um Biomoleküle abzutrennen, während die Polyacrylamidgelelektrophorese eine Technik ist, die vertikal gegossene Polyacrylamidgele verwendet, um Biomoleküle abzutrennen. Dies ist der Hauptunterschied zwischen Agarose- und Polyacrylamid-Gelelektrophorese. Darüber hinaus wird die Agarose-Gelelektrophorese zur Trennung von DNA und RNA verwendet, während die Polyacrylamid-Gelelektrophorese zur Trennung von Nukleinsäuren wie DNA, RNA oder Proteinen verwendet wird.
Die folgende Tabelle fasst den Unterschied zwischen Agarose- und Polyacrylamid-Gelelektrophorese zusammen.
Zusammenfassung – Agarose vs. Polyacrylamid-Gelelektrophorese
Agarose- und Polyacrylamidgelelektrophorese sind zwei Arten von Gelelektrophoresetechniken, die in molekularbiologischen Labors verwendet werden. Die Agarosegelelektrophorese verwendet ein Agarosegel, um Biomoleküle abzutrennen. Agarose ist im Allgemeinen für Menschen nicht toxisch, während Polyacrylamid für Menschen toxisch ist. Darüber hinaus zeigt die Agarose-Gelelektrophorese eine geringe Auflösung, während die Polyacrylamid-Gelelektrophorese eine höhere Auflösung zeigt. Bei der Polyacrylamidgelelektrophorese wird ein Polyacrylamidgel zur Abtrennung von Biomolekülen verwendet. Dies fasst den Unterschied zwischen Agarose- und Polyacrylamid-Gelelektrophorese zusammen
