Der Hauptunterschied zwischen Xylencyanol und Bromphenolblau besteht darin, dass Xylencyanol in 1%igem Agarosegel langsamer wandert, während Bromphenolblau schneller wandert.
Xylencyanol und Bromphenolblau sind wichtige Farbmarker, die zur Überwachung des Prozesses der Agarose-Gelelektrophorese und der Polyacrylamid-Gelelektrophorese verwendet werden können.
Was ist Xylencyanol?
Xylencyanol ist ein elektrophoretischer Farbmarker oder ein Tracking-Farbstoff. Es ist nützlich bei der Überwachung des Prozesses der Agarose-Gelelektrophorese und der Polyacrylamid-Gelelektrophorese. Wenn diese Substanz mit der Probe gemischt wird, wird die Konzentration dieser Substanz typischerweise etwa 0.005 % bis 0,03 %. Einige Synonyme, die wir für Xylolcyanol verwenden können, sind Acid Blue 147, Xylolcyanol, Xylolcyanol FF, Xylolcyanol FF usw.
Die chemische Formel dieser Verbindung ist C25H27N2NaO 6S2 Die Molmasse von Xylencyanol beträgt 538,61 g/mol. Diese Substanz kann mit einer Geschwindigkeit von etwa 4 – 5 Kilobasenpaar DNA-Fragmenten in 1 % Agarosegelen wandern. Dies hängt jedoch von dem Puffer ab, den wir verwenden. Typischerweise kann Xylencyanol auf 6 % Polyacrylamidgel mit einer Geschwindigkeit von ungefähr 140 Basenpaaren DNA-Fragmenten wandern. Andererseits kann es in 20% denaturierender Polyacrylamid-Gelelektrophorese mit einer Rate von 25 Basen Oligonukleotid migrieren.
Die Zahl der Wasserstoffbrückendonatoren von Xylencyanol beträgt 2m und die Zahl der Wasserstoffbrückenakzeptoren 8. Die Zahl der drehbaren Bindungen dieser Verbindung kann mit 7 angegeben werden. Die Komplexität von Xylencyanol kann mit 1120 Grad beschrieben werden. Es hat eine definierte Bindungsstereozentrumszahl von 1.
Was ist Bromphenolblau?
Bromphenolblau ist ein nützlicher pH-Indikator, der als elektrophoretischer Farbmarker und Farbstoff nützlich ist. Es hat den chemischen Namen 3’, 3”, 5’, 5”-Tetrabromphenolsulfonphthalein, BPB. Die chemische Formel dieser Verbindung ist C19H10Br4O5 S. Die Molmasse dieser Verbindung beträgt 669,96 g/mol. Es ist geruchlos und seine Dichte kann mit 2,2 g/mL angegeben werden. Sein Schmelzpunkt liegt bei 273 Grad Celsius und sein Siedepunkt bei 279 Grad Celsius. Wir können es herstellen, indem wir langsam überschüssiges Brom zu einer heißen Lösung von Phenolsulfonphthalein in Eisessig geben.
Bromphenolblau eignet sich als Säure-Base-Indikator im Bereich zwischen pH 3,0 bis 4,6. Es kann von gelb bei pH 3,0 auf pH 4,6 wechseln. Außerdem handelt es sich um eine reversible Reaktion. Strukturell ähnelt Bromphenolblau Phenolphthalein.
Außerdem können wir es als Farbmarker verwenden, um den Prozess der Agarose-Gelelektrophorese und der Polyacrylamid-Gelelektrophorese zu überwachen. Diese Substanz kann bei moderatem pH-Wert eine negative Ladung tragen, wo sie in einem Gel in die gleiche Richtung wie DNA oder Protein wandern kann. Die Migrationsrate kann je nach Geldichte und Pufferzusammensetzung variieren. In einem typischen 1%igen Agarosegel in 1-fachem TAE-Puffer oder TBE-Puffer wandert diese Substanz jedoch mit der gleichen Geschwindigkeit wie ein DNA-Fragment von etwa 300 Basenpaaren.
Was ist der Unterschied zwischen Xylencyanol und Bromphenolblau?
Xylencyanol und Bromphenolblau sind wichtige Farbmarker. Der Hauptunterschied zwischen Xylencyanol und Bromphenolblau besteht darin, dass Xylencyanol in 1 % Agarosegel langsamer wandert, während Bromphenolblau schneller wandert.
Im Folgenden finden Sie eine tabellarische Zusammenfassung der Unterschiede zwischen Xylencyanol und Bromphenolblau zum direkten Vergleich.
Zusammenfassung – Xylencyanol vs. Bromphenolblau
Xylencyanol und Bromphenolblau sind wichtige Farbmarker zur Überwachung des Prozesses der Agarose-Gelelektrophorese und der Polyacrylamid-Gelelektrophorese. Der Hauptunterschied zwischen Xylencyanol und Bromphenolblau besteht darin, dass Xylencyanol in 1 % Agarosegel langsamer wandert, während Bromphenolblau schneller wandert.
