Der Hauptunterschied zwischen gezielter und ungezielter Proteomik besteht darin, dass die gezielte Proteomik darauf abzielt, die Häufigkeit eines bestimmten Proteins zu messen, während ungezielte Proteomik nicht auf ein bestimmtes Protein abzielt.
Proteomik ist die groß angelegte Untersuchung von Proteinen, ihrer Strukturen und Funktionen. Es untersucht das gesamte Proteinkomplement in einer Zelle, einem Gewebe oder einem Organismus unter bestimmten Bedingungen. Es gibt zwei Arten von Proteomik: gezielte Proteomik und ungezielte Proteomik.
Was ist zielgerichtete Proteomik?
Wie der Name schon sagt, zielt die gezielte Proteomik auf ein bestimmtes Protein oder Peptid in einer komplexen Mischung von Proteinen zur Analyse ab. Dann analysiert es das Vorhandensein und die Menge dieses vorgewählten spezifischen Proteins. Diese Methode ist für nur eine Probe oder über mehrere Proben hinweg möglich. Dieses Verfahren ist sogar für eine bestimmte Gruppe von Proteinen geeignet. Dies führt zu präziseren, quantitativeren und sensibleren Daten. Darüber hinaus liefert Massenspektrometrie in Verbindung mit gezielter Proteomik genauere und zuverlässigere Messungen. Diese Methode verwendet für ihre Analyse ein Triple-Quadrupol-Massenspektrometer (QQQ).
Abbildung 01: Proteomik
Targeted Proteomics ist eine geeignete Methode, wenn Sie überprüfen möchten, ob ein Knockdown-Target tatsächlich niedergeschlagen wird, oder wenn Sie ein bestimmtes Protein/Peptid in Blutserum, Gehirnflüssigkeit oder in Zelllysat usw. quantifizieren möchten. Sie können auch Verwenden Sie es, wenn Sie überprüfen möchten, ob ein bestimmtes Protein in verschiedenen Proben oder während eines Zeitverlaufsexperiments unterschiedlich exprimiert wird.
Was ist ungezielte Proteomik?
Untargeted Proteomics zielt, wie der Name schon sagt, nicht auf ein bestimmtes Protein oder Peptid für seine Analyse ab. Discovery Proteomics ist ein anderer Name für Untargeted Proteomics. Tatsächlich handelt es sich um eine eher „globale“Analyse. Im Allgemeinen soll die Durchführung ungezielter Proteomik die Frage beantworten: „Welches Protein oder Proteine befinden sich in dieser Probe oder mehreren Proben?“. Diese Methode ist nicht so empfindlich wie die gezielte Proteomik. Aber es kann viele Proteine identifizieren und messen, einschließlich neuartiger Proteine. Ungezielte Proteomik kann sowohl quantitative als auch qualitative Messungen liefern.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen gezielter und ungezielter Proteomik?
- Gezielte und ungezielte Proteomik misst Proteine in Proben.
- Sie sind wichtig für die Proteomanalyse.
- Diese Methoden verwenden Massenspektrometrie.
Was ist der Unterschied zwischen gezielter und ungezielter Proteomik?
Zunächst ist gezielte Proteomik die Bestimmung des Vorhandenseins und der Menge eines bestimmten Proteins oder Peptids in einer komplexen Mischung von Proteinen. Im Gegensatz dazu ist ungezielte Proteomik die quantitative und qualitative Untersuchung von Proteinen, die in einer Probe oder in Proben vorhanden sind, ohne auf ein bestimmtes Protein abzuzielen. Gezielte Proteomik wird mit vorgewählten oder zielgerichteten Proteinen durchgeführt, während ungezielte Proteomik durchgeführt wird, um die Arten von Proteinen in dieser Probe herauszufinden. Darüber hinaus ist die gezielte Proteomik empfindlicher als die ungezielte Proteomik.
Zusammenfassung – Gezielte vs. ungezielte Proteomik
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass gezielte und ungezielte Proteomik zwei Arten von Proteinstudien sind. Wie ihre Namen vermuten lassen, zielt die gezielte Proteomik auf ein bestimmtes Protein ab, während die ungezielte Proteomik nicht auf ein bestimmtes Protein abzielt. Dies ist der Unterschied zwischen gezielter und ungezielter Proteomik.
