Der Hauptunterschied zwischen FISH und CGH besteht darin, dass FISH eine molekulare Technik ist, die spezifische DNA-Sequenzen auf einem Chromosom mit fluoreszenzmarkierten Sonden nachweist, während CGH eine andere molekulare zytogenetische Technik ist, die Veränderungen in der genomischen DNA nachweist.
Die zytogenetische Analyse spielt in der Medizin eine wichtige Rolle bei der Erkennung von Chromosomenanomalien wie Aneuploidien, Deletionen, Duplikationen und Umlagerungen usw. Chromosomenanomalien führen schließlich zu genetischen Krankheiten wie Krebs, Unfruchtbarkeit, Down-Syndrom, Klinefelter-Syndrom, Turner Syndrom, Leukämie, etc. Es gibt verschiedene molekularzytogenetische Methoden, um die oben genannten Defekte und Krankheiten nachzuweisen. Unter ihnen sind FISH (Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung) und CGH (vergleichende genomische Hybridisierung) zwei leistungsstarke Hybridisierungstechniken. Beide Methoden haben jedoch Vor- und Nachteile.
Was ist FISCH?
FISH ist eine Nukleinsäure-Hybridisierungstechnik, die an einem Teil oder Abschnitt des Gewebes, im gesamten Gewebe oder in den Zellen durchgeführt wird. Es ist eine sondenbasierte Methode. Die Technik basiert auf der Theorie der komplementären Basenpaarung von Watson Crick, was entweder zu DNA-DNA-Hybriden oder DNA-RNA-Hybriden führt, die somit mutierte Gene nachweisen oder das interessierende Gen identifizieren können. Ferner verwendet diese Technik einzelsträngige DNA-Sequenzen, doppelsträngige DNA-Sequenzen, einzelsträngige RNA-Sequenzen oder synthetische Oligonukleotide, die unter Verwendung von Nick-Translation als Sonden hergestellt wurden, die komplementär zu interessierenden Gensequenzen sind. Außerdem ist das wichtigste Merkmal dieser Technik die Markierung von Sonden mit Fluoreszenzfarbstoffen. Somit binden die Sonden an die komplementären Teile des Chromosoms und erleichtern den Nachweis.
Darüber hinaus ist FISH eine hochempfindliche und spezifische Methode. Daher ist es eine übliche Technik sowohl in der Erforschung als auch in der Diagnose von hämatologischen Malignomen und soliden Tumoren. FISH zeigt jedoch eine niedrige Auflösung. Es erfordert auch Vorkenntnisse der Zielanomalie, um Sondensequenzen zu entwerfen.
Abbildung 01: FISCH
Es gibt viele Anwendungen von FISH, hauptsächlich in der molekularen Diagnostik von Infektionskrankheiten, um das Vorhandensein von Krankheitserregern zu identifizieren und den Erreger über die molekulare Diagnostik zu bestätigen. Darüber hinaus ist FISH eine häufig verwendete Technik in den Bereichen Entwicklungsbiologie, Karyotypisierung und phylogenetische Analyse sowie physikalische Kartierung von Chromosomen.
Was ist CGH?
Vergleichende genomische Hybridisierung (CGH) ist eine weitere DNA-basierte molekulare zytogenetische Technik, die die Veränderungen von genomischen DNA-Sequenzen erkennen kann. Die Methode ist eine fortschrittliche Methode, die Chromosomen- und Genmodifikationen analysieren kann, um die Veränderungen oder Veränderungen in den genomischen DNA-Sequenzen zu erkennen. Außerdem erfordert CGH die Isolierung und Fragmentierung von DNA aus der experimentellen Probe und der Referenzprobe. Dann sollten die Proben mit zwei verschiedenen Fluoreszenzfarbstoffen (normalerweise rot und grün) markiert werden. Später werden beide Proben gemischt und für eine kompetitive Hybridisierung zugelassen. Der letzte Schritt ist die Analyse der Proben auf DNA-Veränderungen wie Genduplikation, Genverlust usw. Insbesondere werden die Unterschiede in der Anzahl der DNA-Kopien zwischen der Testprobe und der Kontrollprobe gemessen.
Abbildung 02: CGH
Eine weitere Version von CGH ist jetzt verfügbar; es ist eine fortschrittlichere Methode als die normale CGH. Es ist eine Technik, die als Array-basiertes CGH oder aCGH bezeichnet wird. aCGH ermöglicht die präzise Identifizierung von Gen- oder Sequenzdeletionen in vielen tausend Sequenzen in einem einzigen Experiment.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen FISH und CGH?
- FISH und CGH sind zwei molekulare Techniken.
- Sowohl FISH als auch CGH beruhen auf Nukleinsäure-Hybridisierung.
- Außerdem benötigen beide Techniken spezielle Sonden, um spezifische DNA-Ziele nachzuweisen.
- Wir verwenden sie zur pränatalen und postnatalen Diagnose genetischer Erkrankungen.
- Darüber hinaus sind sowohl FISH als auch CGH sehr leistungsfähige Werkzeuge, um genomische Veränderungen zu untersuchen.
- Sie verwenden fluoreszierende Farbstoffe, um Sonden zu markieren.
Was ist der Unterschied zwischen FISH und CGH?
FISH ist ein In-situ-Hybridisierungsverfahren, bei dem fluoreszierende Sonden zum Nachweis spezifischer DNA-Sequenzen verwendet werden, während CGH eine molekulare Hybridisierungstechnik ist, die die Veränderungen genomischer DNA-Sequenzen erkennt. Das ist also der Hauptunterschied zwischen FISH und CGH.
Darüber hinaus erfordert FISH Vorkenntnisse über die Zielanomalie, um Sondensequenzen zu entwerfen, während CGH keine Vorkenntnisse erfordert. Ein weiterer Unterschied zwischen FISH und CGH besteht darin, dass FISH eine begrenzte Auflösung zeigt, während aCGH eine hohe Auflösung zeigt.
Die folgende Infografik fasst den Unterschied zwischen FISH und CGH zusammen.
Zusammenfassung – FISH vs. CGH
FISH und CGH sind zwei molekulare zytogenetische Techniken, die den Nachweis interessierender Gensequenzen erleichtern. FISH erleichtert den Nachweis spezifischer DNA-Sequenzen auf einem Chromosom unter Verwendung fluoreszenzmarkierter Sonden, während CGH den Nachweis von Veränderungen in der genomischen DNA erleichtert. Das ist also der Hauptunterschied zwischen FISH und CGH.
