Der Hauptunterschied zwischen CGH und Array-CGH besteht darin, dass CGH eine traditionelle molekulare zytogenetische Methode zur Analyse der Variation der Kopienzahl in der DNA einer Testprobe mit geringerer Auflösung ist, während Array-CGH eine vollautomatische molekulare zytogenetische Methode für ist Analyse der Variation der Kopienzahl in der DNA einer Testprobe mit höherer Auflösung.
CGH und Array-CGH sind zwei Techniken, um Variationen der Kopienzahl bei Individuen zu erkennen. Die Variation der Kopienzahl bezieht sich auf die Abschnitte des Genoms, die wiederholt werden. Die Kopienzahl variiert zwischen den Individuen. Kopienzahlvariationen werden allgemein in zwei Gruppen eingeteilt: kurze Wiederholungen und lange Wiederholungen. Eines der bekanntesten Beispiele für eine Short-Copy-Number-Variation ist die Wiederholung des CAG-Trinukleotids im Huntingtin-Gen. Dies verursacht eine neurologische Störung namens Huntingtin. Das beste Beispiel für die Variation der Kopienzahl bei langen Wiederholungen ist das Alpha-Amylase-Gen, das eine Insulinresistenz verursacht. Die Variation der Kopienzahl kann durch Techniken wie FISH, CGH und Array-CGH erkannt werden.
Was ist CGH?
CGH ist eine traditionelle molekulare zytogenetische Methode zur Analyse der Variation der Kopienzahl in der DNA einer Testprobe im Vergleich zu einer Referenzprobe. Es hat eine geringere Auflösung im Vergleich zu automatisierten Techniken. Das Ziel dieser Technik ist es, zwei genomische DNA-Proben, die aus unterschiedlichen Quellen stammen, schnell und effizient zu vergleichen.
Abbildung 01: CGH
Das Verfahren beinh altet die Isolierung von DNA aus zwei Quellen: Test und Referenz. Der nächste Schritt ist dann die unabhängige Markierung von Test- und Referenz-DNA-Proben mit Fluorophoren unterschiedlicher Farbe. Später wurden die beiden DNA-Proben denaturiert, um die einzelsträngigen DNA-Proben zu erh alten. Schließlich wurde die Hybridisierung der beiden resultierenden DNA-Proben in einem Verhältnis von 1:1 zu einer normalen Metaphase-Ausbreitung von Chromosomen durchgeführt. Die chromosomalen Unterschiede zwischen den beiden Quellen können unter Verwendung eines Fluoreszenzmikroskops und einer Computersoftware identifiziert werden. Darüber hinaus ist die CGH-Technik nur in der Lage, unausgeglichene Chromosomenanomalien zu erkennen.
Was ist Array-CGH?
Array CGH ist eine vollautomatische molekulare zytogenetische Methode zur Analyse der Variation der Kopienzahl in der DNA einer Testprobe im Vergleich zu einer Referenzprobe. Es hat eine höhere Auflösung und wurde entwickelt, um die Einschränkungen des traditionellen CGH zu minimieren. Array CGH kombiniert die Prinzipien von CGH mit der Verwendung von Microarrays. Anstatt Metaphase-Chromosomen zu verwenden, verwendet diese Methode Objektträger, die mit kleinen DNA-Segmenten als Ziele angeordnet sind. Diese Mikroarrays wurden hergestellt, indem eine kleine Menge DNA (Sonden) auf einem festen Glasträger abgeschieden und immobilisiert wurde. Die Größe der Sonden kann vom Oligonukleotid bis zum künstlichen Bakterienchromosom variieren.
Abbildung 02: Array CGH
Unabhängig von den Sonden ist die grundlegende Methode der Array-CGH der CGH ähnlich. Sobald die Mikroarray-h altigen Sonden vorbereitet sind, werden die beiden DNA-Proben (Test und Referenz), die mit unterschiedlich farbigen Fluorophoren markiert sind, gemischt und dem Mikroarray hinzugefügt. Da die DNA in den Proben aufgrund von Denaturierung einzelsträngig ist, hybridisiert diese DNA mit angeordneten einzelsträngigen Sonden. Unter Verwendung eines digitalen Bildgebungssystems ist es möglich, die chromosomalen Unterschiede zwischen den beiden Quellen zu identifizieren.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen CGH und Array-CGH?
- CGH und Array-CGH sind zwei Techniken, um Kopienzahlvariationen zu erkennen.
- Das sind molekularzytogenetische Methoden.
- Beide Methoden diagnostizieren unausgeglichene Chromosomenanomalien.
- Fluorophore sind an beiden Methoden beteiligt.
- Beide Methoden können verwendet werden, um genetische Störungen aufgrund von Kopienzahlvariationen zu erkennen.
- Sie werden häufig in der vergleichenden Genomanalyse verwendet.
Was ist der Unterschied zwischen CGH und Array-CGH?
CGH ist eine traditionelle molekulare zytogenetische Methode zur Analyse der Variation der Kopienzahl in der DNA einer Testprobe, die eine niedrigere Auflösung hat, während die Array-CGH eine vollautomatische molekulare zytogenetische Methode zur Analyse der Variation der Kopienzahl in der DNA einer Testprobe ist das hat eine höhere Auflösung. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen CGH und Array-CGH. Darüber hinaus hybridisieren bei CGH Test- und Referenz-DNA-Proben mit einer normalen Metaphaseverteilung von Chromosomen, aber bei Array-CGH hybridisieren Test- und Referenz-DNA-Proben mit den immobilisierten DNA-Sonden, die Microarray enth alten.
Die folgende Infografik listet die Unterschiede zwischen CGH und Array-CGH in tabellarischer Form zum direkten Vergleich auf.
Zusammenfassung – CGH vs. Array-CGH
CGH und Array-CGH sind zwei molekulare zytogenetische Techniken zum Nachweis unausgeglichener Chromosomenanomalien. Sie werden häufig in der vergleichenden Genomanalyse verwendet. CGH ist eine traditionelle molekulare zytogenetische Methode zur Analyse der Variation der Kopienzahl in der DNA einer Testprobe mit geringerer Auflösung. Im Gegensatz dazu ist die Array-CGH eine vollautomatisierte molekulare zytogenetische Methode zur Analyse der Variation der Kopienzahl in der DNA einer Testprobe mit einer höheren Auflösung. Somit fasst dies den Unterschied zwischen CGH und Array-CGH zusammen.
