Der Hauptunterschied zwischen Syntenie und Kollinearität besteht darin, dass Syntenie die physikalische Co-Lokalisierung genetischer Loci auf demselben Chromosom in Arten ist, während Kollinearität die physikalische Co-Lokalisierung genetischer Loci auf demselben Chromosom in verschiedenen Arten ist dieselbe Reihenfolge.
Syntenie und Kollinearität sind zwei Begriffe, die in der Genomik synonym verwendet werden. Beide Begriffe beschreiben die Genlokalisierungsmuster auf Chromosomen in verschiedenen Arten. Diese verwandten Genanordnungen zwischen den Taxa sind wertvolle Informationen, wenn man auf eine gemeinsame Abstammung von Genen schließen lässt. Syntenie bezieht sich auf die physische Co-Lokalisierung genetischer Loci auf demselben Chromosom in Arten. Kollinearität bezieht sich auf die physikalische Kolokalisierung genetischer Loci auf demselben Chromosom in verschiedenen Arten, die dieselbe Ordnung bewahren. Daher ist es eine Form von Syntenie.
Was ist Synteny?
In verschiedenen Arten gibt es eine Reihe von Genen, die sich auf demselben Chromosom befinden. Und diese physische Kolokalisierung von Genen auf demselben Chromosom in verschiedenen Arten wird als Syntenie bezeichnet. Außerdem liegen diese Gene sehr nahe beieinander auf einem einzigen Chromosom. Die Reihenfolge der Gene muss nicht notwendigerweise gleich sein. Die Lokalisierung von Genen, die auf demselben Chromosom nahe beieinander liegen, findet jedoch in Syntenie statt. Daher beschreibt Syntenie hauptsächlich das Verteilungsmuster von Genen auf einem Chromosom. Diese Muster der Kolokalisierung von Genen weisen auf Beziehungen zwischen verschiedenen Arten und deren Evolution hin. Die Syntenie kann jedoch aufgrund chromosomaler Umlagerungen wie Translokationen, Inversion und Chromosomenfusion usw., Duplikationen, Verlust und ungleicher homologer Rekombination gestört werden.
Abbildung 01: Synteny
Es wird angenommen, dass alle verknüpften Gene syntenisch sind. Jedoch sind nicht alle syntenischen Gene notwendigerweise verknüpft. Sie besitzen gemeinsame Chromosomensequenzen. Menschen haben viele syntenische Gene mit anderen Säugetieren. Außerdem haben viele Getreidesorten syntenische Gene.
Was ist Kollinearität?
Kollinearität ist eine spezifischere Form der Syntenie, bei der sich eine Reihe von Genen auf demselben Chromosom verschiedener Arten in derselben Reihenfolge wie bei der angestammten Art befindet. Daher ist eine Abweichung von der Kollinearität ein zuverlässigeres phylogenetisches Merkmal, da die Kollinearität die gemeinsame Abstammung von Genen erklärt.
Abbildung 02: Kollinearität
Die Multiway-Kollinearitätsanalyse liefert viel zuverlässigere Informationen über die verwandten Arten und ihre Phylogenie.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Syntenie und Kollinearität?
- Sowohl bei der Syntenie als auch bei der Kollinearität befindet sich ein Satz von Loci in zwei verschiedenen Arten auf demselben Chromosom.
- Diese Begriffe beschreiben die physische Co-Lokalisierung genetischer Loci auf demselben Chromosom.
- Kollinearität ist eine spezifischere Form von Syntenie.
- Manchmal werden beide Begriffe in der Genomik synonym verwendet.
- Wenn zwei Regionen kollinear sind, sind sie offensichtlich synten.
- Sie sind nützlich, um auf die Phylogenie zu schließen.
Was ist der Unterschied zwischen Syntenie und Kollinearität?
Syntenie und Kollinearität sind zwei Begriffe, die in der Genomik synonym verwendet werden. Syntenie bezieht sich auf die physische Co-Lokalisierung einer Reihe von Genen in demselben Chromosom in verschiedenen Arten. Kollinearität ist eine Form der Syntenie, bei der der Satz von Genen in der gleichen Reihenfolge zwischen den verschiedenen Arten kolokalisiert ist. Daher ist dies der Hauptunterschied zwischen Syntenie und Kollinearität.
Zusammenfassung – Syntenie vs. Kollinearität
Die Begriffe Syntenie und Kollinearität beziehen sich auf eine Reihe von Genen, die sich bei verschiedenen Arten auf demselben Chromosom befinden. Tatsächlich sind diese Gene in verschiedenen Arten auf demselben Chromosom kolokalisiert. Syntenie beschreibt die physische Kolokalisierung von Genen auf demselben Chromosom in verschiedenen Arten, während Kollinearität eine spezifischere Form von Syntenie ist, bei der die Gensätze in derselben Reihenfolge kolokalisiert sind. Somit fasst dies den Unterschied zwischen Syntenie und Kollinearität zusammen.
