Der Hauptunterschied zwischen molekularem Docking und Scoring besteht darin, dass Docking eine Technik zur Bestimmung der Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen ist, während Scoring ein Prozess zur Bewertung einer bestimmten Pose ist, indem die Anzahl günstiger intermolekularer Wechselwirkungen gezählt wird.
Die Begriffe Molecular Docking und Scoring werden im Bereich Molecular Modeling verwendet. Molekulare Modellierung ist eine Technik, die verwendet wird, um die möglichen Anordnungen verschiedener Moleküle in einer bestimmten Substanz zu bestimmen. Diese Technik ist wichtig, um neue stabile Verbindungen herzustellen.
Was ist molekulares Docking?
Molekulares Docking ist eine Computersimulation der Bindung eines Ligandenkandidaten an einen Rezeptor. Dieses Verfahren sagt die bevorzugte Orientierung eines Moleküls zu einem anderen Molekül voraus, wenn sie aneinander gebunden sind, um einen stabilen Komplex zu bilden. Die aus dieser Technik erh altenen Ergebnisse können verwendet werden, um die Assoziationsstärke oder Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen vorherzusagen. Auch hier ist die molekulare Scoring-Funktion wichtig.
Abbildung 01: Ein einfaches Diagramm, das den Prozess molekularer Wechselwirkungen in biologischen Systemen zeigt
Im Allgemeinen berücksichtigt diese Technik die biologisch relevanten Moleküle wie Proteine, Peptide, Nukleinsäuren, Kohlenhydrate und Lipide. Diese Moleküle sind sehr wichtig und spielen eine wichtige Rolle bei Signalübertragungsmechanismen in unserem Körper. Daher beeinflusst die Orientierung der beiden Moleküle, die für diesen Sign altransduktionsprozess binden werden, die Art des hier erzeugten Signals. Das bedeutet; Molekulares Docking ist wichtig, um sowohl die Stärke als auch die Art des Signals zu bestimmen, das während der Sign altransduktion in biologischen Systemen erzeugt wird.
Darüber hinaus sind molekulare Docking-Techniken wichtig für die Entwicklung strukturbasierter Medikamente. Dies liegt an der Vorhersagbarkeit der Bindungskonformation von kleinen Molekülen wie Liganden an eine geeignete Bindungsstelle.
Was ist molekulares Scoring?
Molecular Scoring ist eine Art mathematischer Funktion, die nützlich ist, um den Fortschritt des molekularen Andockens zu bewerten. Im Bereich der Computerchemie werden Scoring-Funktionen zur Vorhersage der Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen nach dem Docking-Prozess verwendet. Wenn wir beispielsweise ein kleines Molekül eines Partikelmedikaments haben und es ein biologisches Ziel wie ein Protein gibt, können wir die Affinität des Medikaments zur Bindungsstelle bewerten. Darüber hinaus kann das molekulare Scoring verwendet werden, um die intermolekularen Wechselwirkungen zwischen zwei Proteinen oder zwischen einem Protein und DNA-Molekülen vorherzusagen.
Abbildung 02: Scoring-Funktion in Kürze
Die Hauptanwendung des molekularen Scorings liegt in den Prozessen des Arzneimitteldesigns, z. B. virtuelles Screening, De-novo-Design, Lead-Optimierung usw.
Was ist der Unterschied zwischen Molecular Docking und Scoring?
Molekulares Docking und Scoring sind wichtig bei der molekularen Modellierung. Der Hauptunterschied zwischen molekularem Docking und Scoring besteht darin, dass Docking eine Technik ist, mit der die Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen bestimmt wird, während Scoring ein Prozess zur Bewertung einer bestimmten Pose ist, indem die Anzahl günstiger intermolekularer Wechselwirkungen gezählt wird.
Die folgende Infografik fasst den Unterschied zwischen molekularem Docking und Scoring zusammen.
Zusammenfassung – Molecular Docking vs. Scoring
Molekulares Docking und Scoring sind wichtig bei der molekularen Modellierung. Der Hauptunterschied zwischen molekularem Docking und Scoring besteht darin, dass Docking eine Technik ist, mit der die Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen bestimmt wird, während Scoring ein Prozess zur Bewertung einer bestimmten Pose ist, indem die Anzahl günstiger intermolekularer Wechselwirkungen gezählt wird.
