Der Hauptunterschied zwischen Primer und Promotor besteht darin, dass Primer eine kommerziell synthetisierte kurze DNA-Sequenz ist, die in der PCR zur Amplifikation einer Ziel-DNA-Sequenz verwendet wird, während Promotor eine spezifische DNA-Sequenz ist, die eine sichere anfängliche Bindungsstelle für RNA bereitstellt Polymerase und Transkriptionsfaktoren, um die Transkription zu initiieren.
Primer und Promotor sind zwei Arten von DNA-Sequenzen. Primer ist ein kleines DNA-Fragment, das für die Polymerase-Kettenreaktion (PCR) benötigt wird. Es hat kurze Nukleotidsequenzen, die zum flankierenden Ende des DNA-Strangs komplementär sind. Es gibt zwei Arten von Primern, die als Ausgangspunkte für die Synthese neuer DNA-Stränge dienen. Im Gegensatz dazu ist ein Promotor eine spezifische DNA-Sequenz, die sich stromaufwärts der Transkriptionsinitiationsstelle eines Gens befindet. Es interagiert direkt mit den Komponenten des Transkriptionsmechanismus wie RNA-Polymerase und Transkriptionsfaktoren, um die DNA-Transkription zu kontrollieren. Daher binden RNA-Polymerase und andere Transkriptionsfaktoren an die Promotorsequenz und initiieren die Transkription.
Was ist eine Grundierung?
Primer sind kurze DNA-Sequenzen, die für die Amplifikation von Ziel-DNA-Sequenzen entwickelt wurden. Strukturell besitzen sie kurze Nukleotidsequenzen, die komplementär zu den flankierenden Enden der DNA-Doppelstränge sind. Sie sind normalerweise etwa 20 Nukleotide lang. Während der PCR katalysiert die Taq-Polymerase die Addition von Nukleotiden in die bereits vorhandene Nukleotidsequenz. Daher dienen Primer als Ausgangspunkte für die Synthese neuer Stränge. Die Taq-Polymerase arbeitet nur in 5’- bis 3’-Richtung. Daher findet die DNA-Synthese auch in der gleichen 5'-3'-Richtung statt. Da DNA doppelsträngig ist, werden bei der PCR zwei Arten von Primern benötigt. Sie sind bekannt als Forward-Primer und Reverse-Primer, basierend auf der Richtung der Verlängerung des Primers während der DNA-Synthese.
Abbildung 01: Primer
Forward-Primer anne alt mit dem Antisense-DNA-Strang und initiiert die Synthese des +-Strangs des Gens in 5'- bis 3'-Richtung. Es hat eine kurze Nukleotidsequenz, die zum 3'-flankierenden Ende des Antisense-Strangs komplementär ist. Der Reverse-Primer anne alt mit dem Sense-Strang und initiiert die Synthese eines komplementären Strangs des kodierenden Strangs, der – ein Strang des Gens in 5’- bis 3’-Richtung ist. Daher ist der Rückwärtsprimer komplementär zum 3'-Ende des codierenden Strangs gest altet. Sowohl Reverse- als auch Forward-Primer sind wichtig für die Produktion von Millionen bis Milliarden von Kopien bestimmter DNA-Regionen, auf die abgezielt oder die interessiert sind.
Was ist ein Promoter?
Der Promotor ist eine DNA-Sequenz, die sich stromaufwärts oder am 5′-Ende der Transkriptionsinitiationsstelle eines Gens befindet. Es stellt eine Bindungsstelle für RNA-Polymerase und bestimmte regulatorische Elemente bereit, um die Transkription des Gens zu initiieren. Es ist eine regulatorische Sequenz, die zum An- oder Absch alten eines Gens benötigt wird. Es gibt eine spezifische Nukleotidsequenz im Promotor. Es kann 100–1000 Basenpaare haben. Promotor zeigt die Richtung der Transkription. Außerdem gibt es den Sense-Strang an, der transkribiert werden soll.
Abbildung 02: Promotor eines Gens
Es gibt drei Arten von Promotorelementen: Kernpromotor, proximaler Promotor und distaler Promotor. Der Core-Promotor ist der minimale Teil des Promotors, der erforderlich ist, um die Transkription zu initiieren. Es befindet sich am weitesten proximal zum Startcodon. TATA-Box ist eine konservierte Region, die in vielen eukaryontischen Kernpromotoren gefunden wird. Es befindet sich 25 bis 35 Basenpaare stromaufwärts der Transkriptionsstartstelle. Der proximale Promotor befindet sich weiter stromaufwärts des Kernpromotors. Im Allgemeinen befindet es sich 250 Basenpaare stromaufwärts des Startcodons und enthält primäre regulatorische Elemente. Der distale Promotor befindet sich stromaufwärts des proximalen Promotors und enthält zusätzliche regulatorische Elemente. Bakterielle Promotoren haben zwei kurze Sequenzelemente in ihren Promotoren. TATAAT ist die Consensus-Sequenz, die sich bei –10 des bakteriellen Promotors befindet, während TTGACA die Consensus-Sequenz bei –35 ist. Sie sind als -10-Element und -35-Element bekannt.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Primer und Promoter?
- Primer und Promotor sind zwei Arten von DNA-Sequenzen.
- Sie bestehen aus Nukleotidsequenzen.
- Sowohl Primer als auch Promotor sind wichtig für die Genexpression.
Was ist der Unterschied zwischen Primer und Promoter?
Primer ist eine kurze Nukleotidsequenz, die für die Amplifikation von Ziel-DNA entwickelt wurde. Im Gegensatz dazu ist der Promotor eine spezifische regulatorische DNA-Sequenz, die stromaufwärts der Transkriptionsinitiationsstelle eines Gens gefunden wird. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Primer und Promoter. Primer sind etwa 20 Basenpaare lang, während Promotoren 100–1000 Basenpaare haben können. Funktionell dienen Primer als Startsequenzen für die Neustrangsynthese, während Promotoren die Gentranskription steuern, indem sie Bindungsstellen für RNA-Polymerase und andere Transkriptionsfaktoren bereitstellen.
Außerdem ist ein Promotor als Richtung der Transkription definiert und zeigt den Sense-Strang eines Gens an. Strukturell ist der Primer eine kurze, einzelsträngige DNA-Sequenz, während der Promotor eine lange doppelsträngige DNA-Sequenz ist.
Die folgende Infografik enthält weitere Vergleiche in Bezug auf den Unterschied zwischen Primer und Promoter.
Zusammenfassung – Primer vs. Promoter
Primer sind kurze Nukleotidsequenzen, die komplementär zu den flankierenden Enden des Ziel-DNA-Doppelstrangs sind. Bei der PCR werden zwei Arten von Primern verwendet. Sie dienen als Ausgangssequenzen für die Synthese neuer Stränge. Primer werden kommerziell entwickelt und sind temperaturstabile Sequenzen. Andererseits ist der Promotor eine regulatorische Sequenz eines Gens, das sich stromaufwärts der Transkriptionsinitiationsstelle befindet. Promotoren steuern die Transkription von Genen. Sie stellen Bindungsstellen für RNA-Polymerase und Transkriptionsfaktoren bereit, um die Transkription zu initiieren. Dies ist also die Zusammenfassung des Unterschieds zwischen Primer und Promotor.
