Der Hauptunterschied zwischen Polysomen-Profiling und Ribosomen-Profiling besteht darin, dass das Polysomen-Profiling das Ribosomenverh alten unter Verwendung von Ribosom und mRNA (Polysom) während der Translation analysiert, während das Ribosomen-Profiling das Ribosomenverh alten nur unter Verwendung der mRNA-Sequenz während der Translation analysiert.
Translation ist die zweite Phase der Proteinsynthese, die die Information in der mRNA in eine Aminosäuresequenz umwandelt. Translatomics ist eine Untersuchung von ORFs (offene Leserahmen), die in einer Zelle eines Organismus aktiv translatiert werden. Polysom- und Ribosomenprofilierungstechniken sind zwei Arten von Techniken auf dem Gebiet der Molekularbiologie, um verschiedene Parameter im Zusammenhang mit der Analyse des Translatoms zu bewerten und abzuleiten.
Was ist Polysom-Profiling?
Polysom-Profiling ist eine Technik, die auf den Translationsstatus einer bestimmten mRNA schließen lässt, indem das Verh alten sowohl des Ribosoms als auch der mRNA (Polysom) analysiert wird. Mit anderen Worten, diese Technik liefert Daten und Schlussfolgerungen zur Assoziation von mRNAs mit Ribosomen. Das Polysom bezieht sich auf die Gruppe von Ribosomen, die an eine mRNA gebunden sind, die während der Elongationsphase der Translation vorhanden ist.
Abbildung 01: Polysomenprofilierung
Polysom-Profiling erfordert das Zelllysat, das dann zentrifugiert wird. Die zentrifugierte Probe wird dann basierend auf ihrer Dichte getrennt, um die kleinen und großen Untereinheiten der Ribosomen und die entsprechende mRNA, die an der Bildung des Polysoms beteiligt ist, zu charakterisieren. Darüber hinaus beinh altet das Verfahren auch die Messung der optischen Dichte. Für die Polysomen-Profilierung sind Experten erforderlich.
Die Polysom-Profiling-Technik ist ein wichtiges Werkzeug für viele Anwendungen. Wissenschaftler verwenden diese Technik, um den Translationsgrad in Zellen zu untersuchen. Genauer gesagt ist es ein Werkzeug, um genaue Informationen über die Untersuchung einzelner Proteine und ihrer spezifischen mRNAs bereitzustellen. Im Zusammenhang mit der Untersuchung des Translationsgrades einer bestimmten mRNA ist die Polysomen-Profiling-Technik von entscheidender Bedeutung. Hier können die 3’- und 5’-Sequenzen einer mRNA hinsichtlich ihrer Auswirkungen auf die produzierte mRNA-Menge und das Translationsniveau untersucht werden.
Was ist Ribosomen-Profiling?
Ribosome Profiling ist eine Technik, die das Verh alten des Ribosoms in Bezug auf seine mRNA während der Translation analysiert. Diese Technik wurde von Joan Steitz und Marilyn Kozak gefunden und entwickelt. Später wurde diese Technologie von zwei Wissenschaftlern, Nicholas und Jonathan, in Kombination mit der Sequenzierung der nächsten Generation weiterentwickelt, was zur Entwicklung verschiedener verwandter Techniken führte, wie z.
Abbildung 02: Ribosomensequenzierung
Das Verfahren der Ribosomenprofilierung umfasst das Isolieren der mRNA, das Entfernen der RNA, die nicht an Ribosomen gebunden ist, und das Abtrennen der an Ribosomen gebundenen mRNA. Nach diesem Verfahren wird das mRNA-Isolat revers transkribiert und die cDNA-Synthese findet statt. Schließlich können Sequenzdaten mit dem Translationsprofil abgeglichen werden, um die Eigenschaften des Ribosomenverh altens in Bezug auf die mRNA abzuleiten.
Ribosomen-Profiling hilft vielen Forschern, die Position von Startstellen der Translation, die Ergänzung von übersetzten offenen Leserahmen (ORFs) in einer Zelle oder einem Gewebe, die Verteilung von Ribosomen auf mRNA und die Rate von zu identifizieren und abzuleiten Ribosomen übersetzen. Ribosomen-Profiling ist auch bekannt als Ribosomen-Footprinting oder Ribo Seq.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Polysomen-Profiling und Ribosomen-Profiling?
- Polysomen- und Ribosomenprofilierung sind molekularbiologische Techniken, die in der Forschung wichtig sind.
- Sie geben Auskunft über den Übersetzungsprozess.
- Beide Profiling-Prozesse liefern Daten durch Analyse des Translatoms.
- Professionelle Experten werden benötigt, um beide Techniken durchzuführen, um genaue Ergebnisse zu erzielen.
- Bioinformatik-Tools spielen bei beiden Techniken eine wichtige Rolle.
Was ist der Unterschied zwischen Polysomen-Profiling und Ribosomen-Profiling?
Polysom-Profiling analysiert das Ribosomenverh alten unter Verwendung sowohl des Ribosoms als auch der mRNA (Polysom) während der Translation, während das Ribosomen-Profiling das Ribosomenverh alten nur unter Verwendung der mRNA-Sequenz während der Translation analysiert. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Polysomen-Profiling und Ribosomen-Profiling. Darüber hinaus umfasst das Polysom-Profiling Techniken wie Dichtegradientenzentrifugation und optische Dichtemessungen, während das Ribosomen-Profiling mRNA-Extraktions- und Sequenzierungstechniken umfasst. Außerdem ist das Ribosomen-Profiling genauer als das Polysomen-Profiling.
Die folgende Infografik zeigt die Unterschiede zwischen Polysom- und Ribosomenprofilierung in tabellarischer Form zum direkten Vergleich.
Zusammenfassung – Polysomen-Profiling vs. Ribosomen-Profiling
Die Translation ist die zweite Phase der Proteinsynthese, bei der die Information auf der mRNA-Sequenz in eine Aminosäuresequenz umgewandelt wird. Dieser Prozess erfordert eine mRNA-Vorlage, Ribosomen, Aminosäuren, tRNA und andere Faktoren. Polysomen- und Ribosomen-Profiling sind zwei molekulare Techniken. Die Polysomen-Profilerstellung analysiert das Ribosomenverh alten unter Verwendung sowohl des Ribosoms als auch der mRNA (Polysom) während der Translation, während die Ribosomen-Profilerstellung das Ribosomenverh alten nur unter Verwendung der mRNA-Sequenz während der Translation analysiert. Polysom-Profiling umfasst Techniken wie Dichtegradientenzentrifugation und Messungen der optischen Dichte. Das Ribosomen-Profiling umfasst Techniken wie mRNA-Extraktion, cDNA-Synthese und Sequenzierung. Dies fasst also den Unterschied zwischen Polysomen-Profiling und Ribosomen-Profiling zusammen.
