Der Hauptunterschied zwischen Ähnlichkeit und Identität bei der Sequenzausrichtung besteht darin, dass Ähnlichkeit die Ähnlichkeit (Ähnlichkeit) zwischen zwei Sequenzen im Vergleich ist, während Identität die Anzahl der Zeichen ist, die genau zwischen zwei verschiedenen Sequenzen übereinstimmen.
Bioinformatik ist ein interdisziplinäres Wissenschaftsgebiet, das hauptsächlich Molekularbiologie und Genetik, Informatik, Mathematik und Statistik umfasst. Sequenzalignment ist ein wichtiger Begriff in der Bioinformatik. Es ist das Verfahren, bei dem die DNA-, RNA- oder Proteinsequenzen angeordnet werden, um Ähnlichkeitsregionen zu identifizieren, die eine Folge der funktionellen, strukturellen oder evolutionären Beziehung zwischen den Sequenzen sind. Am Ende des Alignments werden sie als Zeilen innerhalb einer Matrix dargestellt. Um die identischen Zeichen in aufeinanderfolgenden Sp alten auszurichten, sind zwischen den Resten eingefügte Lücken vorhanden.
Was ist Ähnlichkeit?
Ähnlichkeit im Sequenzalignment ist die Ähnlichkeit zwischen zwei Sequenzen im Vergleich. Diese Tatsache ist abhängig von der Identität der Sequenzen. Ähnlichkeit zeigt das Ausmaß, in dem die Reste ausgerichtet sind. Daher enth alten ähnliche Sequenzen ähnliche Eigenschaften. In der Bioinformatik ist Ähnlichkeit ein Werkzeug, um die Ähnlichkeit zwischen zwei Proteinen zu beurteilen.
Abbildung 01: Ähnlichkeit in der Sequenzausrichtung
Der Sequenzalignment-Prozess besteht aus zwei Hauptschritten. Der erste Schritt ist das paarweise Alignment, das dabei hilft, das optimale Alignment zwischen zwei Sequenzen (einschließlich Lücken) mithilfe von Algorithmen wie BLAST, FastA und LALIGN zu finden. Der Abgleichalgorithmus findet die minimale Anzahl von Bearbeitungsvorgängen; in-dels und Substitutionen, um eine Sequenz an der anderen Sequenz auszurichten. Nach dem paarweisen Alignment ist es notwendig, zwei quantitative Parameter aus jedem paarweisen Vergleich zu erh alten. Sie sind Identität und Ähnlichkeit.
Was ist Identität?
Identität im Sequenz-Alignment ist die Anzahl der Zeichen, die genau zwischen zwei verschiedenen Sequenzen übereinstimmen. Lücken zählen daher bei der Identitätsfeststellung nicht. Die Messung wird als relativ zu der kürzeren Sequenz unter den beiden Sequenzen angesehen. Es impliziert deutlich, dass es dort wirkt, wo die Sequenzidentität nicht transitiv ist. Wenn X=Y und Y=Z, dann ist X nicht notwendigerweise gleich Z. Dies wird in Form des Identitätsabstandsmaßes abgeleitet.
Abbildung 02: Identität im Sequenzalignment
Zum Beispiel hat X eine Sequenz von AAGGCTT, Y hat eine Sequenz von AAGGC und Z hat eine Sequenz von AAGGCAT. Identität zwischen X und Y ist 100 % {5 identische Nukleotide/min [Länge (X), Länge (Y)]}. Die Identität zwischen Y und Z ist ebenfalls 100 %. Aber die Identität zwischen X und Z ist nur 85% {(6 identische Nukleotide / 7)}.
Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Ähnlichkeit und Identität beim Sequenzalignment?
- Ähnlichkeit und Identität sind zwei Begriffe, die wir beim Sequenzalignment verwenden.
- Außerdem beziehen sie sich auf die Ähnlichkeit zwischen den beiden Sequenzen.
- Außerdem drücken wir sie als Prozentwert aus.
Was ist der Unterschied zwischen Ähnlichkeit und Identität beim Sequenzalignment?
Ähnlichkeit in der Ausrichtung gibt die Ähnlichkeit zwischen zwei Sequenzen an, wenn sie verglichen werden, während die Identität in der Sequenzausrichtung die Anzahl der Zeichen angibt, die genau zwischen zwei verschiedenen Sequenzen übereinstimmen. Daher ist dies der Hauptunterschied zwischen Ähnlichkeit und Identität beim Sequenzalignment.
Zusammenfassung – Ähnlichkeit vs. Identität beim Sequenzalignment
Sequenzalignment hilft bei der Identifizierung von Regionen mit Ähnlichkeiten in DNA, RNA oder Proteinen, die auf funktionelle, strukturelle oder evolutionäre Beziehungen zwischen den Sequenzen zurückzuführen sind. Daher sind Ähnlichkeit und Identität zwei Schlüsselbegriffe im Kontext des Sequenzalignments. Der Hauptunterschied zwischen diesen beiden Begriffen besteht darin, dass Ähnlichkeit die Ähnlichkeit zwischen zwei Sequenzen im Vergleich ist, während Identität die Anzahl der Zeichen ist, die genau zwischen zwei verschiedenen Sequenzen übereinstimmen. Dies ist also die Zusammenfassung des Unterschieds zwischen Ähnlichkeit und Identität beim Sequenzalignment.
